210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3616 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0751  lysophospholipid transporter LplT  80.1 
 
 
415 aa  644    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3462  lysophospholipid transporter LplT  94.84 
 
 
407 aa  746    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3616  lysophospholipid transporter LplT  100 
 
 
407 aa  800    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0767  lysophospholipid transporter LplT  78.97 
 
 
404 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1028  lysophospholipid transporter LplT  75.25 
 
 
406 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0976  lysophospholipid transporter LplT  75.25 
 
 
406 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3245  lysophospholipid transporter LplT  75.25 
 
 
406 aa  552  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0158938  hitchhiker  0.00481427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3829  lysophospholipid transporter LplT  75.37 
 
 
398 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  0.48267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02683  predicted inner membrane protein  72.25 
 
 
397 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.018578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0855  major facilitator superfamily MFS_1  72.25 
 
 
397 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.191502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3027  lysophospholipid transporter LplT  72.25 
 
 
397 aa  539  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2983  lysophospholipid transporter LplT  72.5 
 
 
397 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0384881  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0880  lysophospholipid transporter LplT  72.25 
 
 
397 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16932  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02644  hypothetical protein  72.25 
 
 
397 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0181673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2982  lysophospholipid transporter LplT  72.5 
 
 
397 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0020769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4102  lysophospholipid transporter LplT  72.25 
 
 
397 aa  537  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120469  hitchhiker  0.000572662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3155  lysophospholipid transporter LplT  73.45 
 
 
387 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00836608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3222  lysophospholipid transporter LplT  74.44 
 
 
400 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3237  lysophospholipid transporter LplT  74.44 
 
 
400 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000025684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3156  lysophospholipid transporter LplT  74.44 
 
 
400 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3337  lysophospholipid transporter LplT  74.44 
 
 
400 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044358 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3276  lysophospholipid transporter LplT  75.25 
 
 
397 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.120069  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3174  lysophospholipid transporter LplT  73.95 
 
 
400 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2630  lysophospholipid transporter LplT  53.98 
 
 
403 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1811  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 
406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2310  lysophospholipid transporter LplT  43.09 
 
 
389 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2116  lysophospholipid transporter LplT  40.74 
 
 
424 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0816109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1718  lysophospholipid transporter LplT  41.44 
 
 
405 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.964759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2254  lysophospholipid transporter LplT  38.52 
 
 
416 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0274694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0918  lysophospholipid transporter LplT  38.98 
 
 
439 aa  259  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2006  lysophospholipid transporter LplT  38.17 
 
 
435 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1659  lysophospholipid transporter LplT  37.47 
 
 
435 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2478  lysophospholipid transporter LplT  37 
 
 
435 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00685032  hitchhiker  0.000365442 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1576  lysophospholipid transporter LplT  37.47 
 
 
435 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3233  lysophospholipid transporter LplT  37.47 
 
 
435 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2459  lysophospholipid transporter LplT  37.47 
 
 
435 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2079  lysophospholipid transporter LplT  37.47 
 
 
451 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2515  lysophospholipid transporter LplT  37.47 
 
 
451 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1351  lysophospholipid transporter LplT  37.47 
 
 
451 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0425999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1360  lysophospholipid transporter LplT  38.17 
 
 
435 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400327  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1237  lysophospholipid transporter LplT  37 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111638  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5349  lysophospholipid transporter LplT  36.77 
 
 
435 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6037  lysophospholipid transporter LplT  37.47 
 
 
435 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00485648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2072  lysophospholipid transporter LplT  38.64 
 
 
435 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2040  lysophospholipid transporter LplT  37.47 
 
 
435 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2059  lysophospholipid transporter LplT  37.47 
 
 
435 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690395  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3825  lysophospholipid transporter LplT  41.89 
 
 
419 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339646  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1941  lysophospholipid transporter LplT  38.64 
 
 
435 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23021  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2465  lysophospholipid transporter LplT  40.94 
 
 
403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1984  lysophospholipid transporter LplT  40.1 
 
 
421 aa  236  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.943557  normal  0.503134 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0924  lysophospholipid transporter LplT  37.12 
 
 
439 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358434  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1370  lysophospholipid transporter LplT  39.02 
 
 
438 aa  229  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495863  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0487  lysophospholipid transporter LplT  36.82 
 
 
427 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1309  lysophospholipid transporter LplT  38.6 
 
 
459 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00718572  normal  0.641684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0921  lysophospholipid transporter LplT  36.64 
 
 
417 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1243  lysophospholipid transporter LplT  38.79 
 
 
438 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.621114  normal  0.61438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0228  lysophospholipid transporter LplT  38.5 
 
 
434 aa  223  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0252  lysophospholipid transporter LplT  37.14 
 
 
426 aa  222  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.697841  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0193  lysophospholipid transporter LplT  38.31 
 
 
425 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0175  lysophospholipid transporter LplT  38.31 
 
 
425 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4338  lysophospholipid transporter LplT  37.14 
 
 
434 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497133  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1935  lysophospholipid transporter LplT  35.97 
 
 
439 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0192  lysophospholipid transporter LplT  36.57 
 
 
426 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1399  lysophospholipid transporter LplT  36.74 
 
 
439 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344137  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1618  lysophospholipid transporter LplT  36.94 
 
 
432 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2519  lysophospholipid transporter LplT  36.71 
 
 
432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177728  hitchhiker  0.00000217459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0130  lysophospholipid transporter LplT  36.57 
 
 
426 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1454  lysophospholipid transporter LplT  40 
 
 
422 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812934  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3608  lysophospholipid transporter LplT  38.24 
 
 
422 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0310  lysophospholipid transporter LplT  36.12 
 
 
433 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571757  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3563  lysophospholipid transporter LplT  37.62 
 
 
425 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738442  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1398  lysophospholipid transporter LplT  36.7 
 
 
432 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  27.48 
 
 
626 aa  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0339  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.41 
 
 
888 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.93 
 
 
635 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  27.49 
 
 
438 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.13 
 
 
645 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.88 
 
 
635 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  26.72 
 
 
635 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  27.01 
 
 
624 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  25.37 
 
 
644 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1153  major facilitator transporter  23.18 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  25.37 
 
 
604 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  25.37 
 
 
604 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  25.37 
 
 
644 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  25.37 
 
 
644 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1690  major facilitator transporter  26.89 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.86317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1480  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 
1049 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.529566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  24.94 
 
 
644 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.54 
 
 
1136 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1511  major facilitator transporter  26.63 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.98 
 
 
1128 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.4 
 
 
1131 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  26.61 
 
 
644 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  24.83 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.17 
 
 
644 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.94 
 
 
626 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0921  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  23.91 
 
 
1170 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.81 
 
 
625 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.55 
 
 
644 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>