55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3050 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  952    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  95.41 
 
 		 458 aa  895    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  72.32 
 
 		 448 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  74.55 
 
 		 448 aa  684    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  72.1 
 
 		 448 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  72.32 
 
 		 448 aa  677    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  63.86 
 
 		 451 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  64.78 
 
 		 452 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  63.53 
 
 		 454 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  60.59 
 
 		 451 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  62.62 
 
 		 451 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  60.76 
 
 		 451 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  61.85 
 
 		 448 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  62.62 
 
 		 451 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  61.76 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  55.25 
 
 		 473 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  52.26 
 
 		 441 aa  450  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  52.26 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  51.22 
 
 		 452 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  53.99 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  51.16 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  51.42 
 
 		 452 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  49.17 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  45.35 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  38.97 
 
 		 415 aa  239  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  35.14 
 
 		 457 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  35.14 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  37.68 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  36.46 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.51 
 
 		 769 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4473  putative signal peptide protein  45.14 
 
 		 208 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  31.5 
 
 		 487 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.63 
 
 		 1027 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.62 
 
 		 1372 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  25.27 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.8 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.95 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  25.8 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  24 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  25.4 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49693  predicted protein  26.03 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  24.87 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  25 
 
 		 438 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  25.61 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  24.84 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  31.32 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  28.57 
 
 		 1844 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  25.27 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  22.86 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  23.21 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  24.65 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  23.83 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  28.46 
 
 		 510 aa  43.9  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  22.92 
 
 		 495 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  23.51 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>