166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2052 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  56.41 
 
 		 615 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  56.41 
 
 		 615 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  56.59 
 
 		 611 aa  649    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  56.24 
 
 		 615 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  57.93 
 
 		 615 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  56.41 
 
 		 615 aa  645    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  59.06 
 
 		 607 aa  658    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  57.93 
 
 		 615 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  68.22 
 
 		 563 aa  806    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  59.24 
 
 		 606 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  90.52 
 
 		 576 aa  1078    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  59.51 
 
 		 618 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  56.41 
 
 		 615 aa  645    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  56.41 
 
 		 615 aa  646    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  57.83 
 
 		 616 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  59.84 
 
 		 613 aa  731    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  60.2 
 
 		 596 aa  721    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  67.99 
 
 		 564 aa  793    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1181    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  59.51 
 
 		 618 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  56.41 
 
 		 615 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  56.41 
 
 		 615 aa  646    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  57.75 
 
 		 615 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  34.81 
 
 		 513 aa  297  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  35.17 
 
 		 512 aa  296  9e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  33.33 
 
 		 513 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  32.5 
 
 		 530 aa  282  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  33.93 
 
 		 524 aa  273  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.12 
 
 		 565 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.43 
 
 		 559 aa  253  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.03 
 
 		 560 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.15 
 
 		 547 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  40.52 
 
 		 563 aa  243  9e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1072  hypothetical protein  51.87 
 
 		 475 aa  239  9e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  34.8 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2146  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.32 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.37 
 
 		 549 aa  238  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1831  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.66 
 
 		 542 aa  237  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.94 
 
 		 560 aa  236  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 521 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.92 
 
 		 566 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1889  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.24 
 
 		 558 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.362103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1924  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.04 
 
 		 521 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0712521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  32.4 
 
 		 546 aa  233  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.89 
 
 		 549 aa  231  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.92 
 
 		 472 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.53 
 
 		 525 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315438  normal  0.0441683 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.92 
 
 		 563 aa  226  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.7 
 
 		 521 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  37.85 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.25 
 
 		 461 aa  217  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  31.37 
 
 		 554 aa  213  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  30.65 
 
 		 598 aa  213  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.65 
 
 		 498 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 451 aa  213  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.95 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.76 
 
 		 484 aa  212  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 556 aa  209  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.63 
 
 		 549 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.37 
 
 		 465 aa  206  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.3 
 
 		 399 aa  206  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.27 
 
 		 560 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.32 
 
 		 473 aa  200  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.27 
 
 		 560 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  31.7 
 
 		 661 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.57 
 
 		 533 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  30.06 
 
 		 530 aa  196  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  34.04 
 
 		 410 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  37.63 
 
 		 419 aa  194  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.57 
 
 		 599 aa  193  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.65 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 668 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  38.98 
 
 		 557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  29.64 
 
 		 571 aa  191  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  38.62 
 
 		 540 aa  189  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.75 
 
 		 636 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 540 aa  189  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.87 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.27 
 
 		 560 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  34.13 
 
 		 568 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.52 
 
 		 545 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.75 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1223  hypothetical protein  36.07 
 
 		 318 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41715  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  31.9 
 
 		 536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  29.85 
 
 		 572 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  30.3 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 595 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.31 
 
 		 540 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.55 
 
 		 516 aa  184  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  29.85 
 
 		 656 aa  183  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.83 
 
 		 637 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.56 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  28.73 
 
 		 631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.08 
 
 		 543 aa  180  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.36 
 
 		 526 aa  180  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  29.62 
 
 		 483 aa  180  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.12 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.45 
 
 		 602 aa  179  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.67 
 
 		 525 aa  178  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>