49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1536 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  86.83 
 
 		 205 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  49.76 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  52.48 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  48.29 
 
 		 208 aa  198  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  46.91 
 
 		 204 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  46.04 
 
 		 203 aa  168  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  39.09 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  40.91 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  40.91 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  40.2 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  39.3 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  39.3 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  35.96 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  36.26 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  37.99 
 
 		 218 aa  117  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  36.11 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  34.62 
 
 		 194 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  35.56 
 
 		 191 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  35.56 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  35 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  35 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  35.56 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  35 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  35.03 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  33.33 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  33.33 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  38.46 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  32.97 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  32.97 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  34.62 
 
 		 193 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  39.85 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  32.78 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  30.93 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  31.74 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  27.27 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  33.33 
 
 		 442 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  32.17 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  31.01 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  43.55 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  38.05 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  43.94 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  42.42 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  42.19 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  35.29 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  37.14 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  44.44 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  41.27 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  48.08 
 
 		 89 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>