67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0642 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0642  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 216 aa  440  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3720  transglycosylase SLT domain-containing protein  59.72 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4182  lytic transglycosylase catalytic  48.9 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4099  lytic transglycosylase catalytic  48.29 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0323  lytic transglycosylase catalytic  48.65 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1640  Lytic transglycosylase catalytic  40.41 
 
 		 196 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2843  Lytic transglycosylase catalytic  46.3 
 
 		 194 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3010  lytic transglycosylase, catalytic  44.9 
 
 		 171 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59660  hypothetical protein  46.79 
 
 		 193 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000384805  hitchhiker  1.2342600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4498  soluble lytic murein transglycosylase  46.79 
 
 		 193 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1456  hypothetical protein  45.16 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0450  putative signal peptide  38.86 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1197  hypothetical protein  46.31 
 
 		 196 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.66344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2334  lytic transglycosylase, catalytic  45.64 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370979  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1177  Lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0529  lytic transglycosylase, catalytic  43.83 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4167  lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.381965  normal  0.719348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3412  lytic transglycosylase catalytic  40.34 
 
 		 196 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.120299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2378  hypothetical protein  46.31 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0965  Lytic transglycosylase catalytic  44.97 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2210  lytic transglycosylase, catalytic  44.97 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.31341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0671  Lytic transglycosylase catalytic  41.46 
 
 		 194 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1276  lytic transglycosylase, catalytic  43.62 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1410  lytic transglycosylase, catalytic  43.62 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.942622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0630  lytic transglycosylase, catalytic  37.13 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2932  lytic transglycosylase, catalytic  46.76 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3303  lytic transglycosylase catalytic  41.46 
 
 		 184 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3939  lytic transglycosylase, catalytic  35.87 
 
 		 178 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5548  lytic transglycosylase catalytic  40.15 
 
 		 268 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00871042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1529  hypothetical protein  40.41 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5194  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  40.41 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6568  lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1319  invasion protein  40.52 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2978  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0593  hypothetical protein  41.03 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3431  Lytic transglycosylase catalytic  35.62 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2614  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6298  hypothetical protein  36.76 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3707  hypothetical protein  36.05 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0917691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0192  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.94 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268096 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0072  invasion protein  36.44 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1708  lytic transglycosylase, catalytic  36.44 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0133415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1661  lytic transglycosylase, catalytic  35.59 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2898  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000087511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1996  lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0368  Lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0336  Lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2548  hypothetical protein  33.06 
 
 		 302 aa  65.1  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2684  lytic transglycosylase catalytic  34.33 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.173573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0040  Lytic transglycosylase catalytic  31.62 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0634  lytic transglycosylase catalytic  28.29 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308805  normal  0.480639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0645  Lytic transglycosylase catalytic  29.58 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.176498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0274  lytic transglycosylase catalytic  30.43 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0613  Lytic transglycosylase catalytic  30.15 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3220  lytic transglycosylase catalytic  28.47 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0761  hypothetical protein  28 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112238  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1124  transglycosylase  28.79 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0281  lytic transglycosylase, catalytic  29.01 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1110  lytic transglycosylase, catalytic  29.01 
 
 		 175 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4195  lytic transglycosylase catalytic  28.47 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1676  lytic transglycosylase catalytic  27.61 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  0.0250145 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1141  hypothetical protein  28.35 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2444  Lytic transglycosylase catalytic  29.03 
 
 		 327 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540003 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  28.12 
 
 		 180 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  30.3 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  31.76 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  35.37 
 
 		 181 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>