More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5090 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5090  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  69.89 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  70.41 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  69.66 
 
 		 283 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1326  enoyl-CoA hydratase  76.92 
 
 		 268 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.63963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  69.89 
 
 		 283 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.42 
 
 		 269 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.27 
 
 		 269 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  73.66 
 
 		 270 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  67.15 
 
 		 283 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2182  enoyl-CoA hydratase  71.11 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  69.78 
 
 		 272 aa  363  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0825  enoyl-CoA hydratase  70 
 
 		 272 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4470  enoyl-CoA hydratase  68.77 
 
 		 285 aa  355  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114118  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  67.82 
 
 		 284 aa  354  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3619  enoyl-CoA hydratase  70.41 
 
 		 284 aa  348  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.397236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0591  enoyl-CoA hydratase  70.04 
 
 		 284 aa  345  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02010  enoyl-CoA hydratase  70.41 
 
 		 283 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2240  enoyl-CoA hydratase  74.23 
 
 		 267 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3834  enoyl-CoA hydratase  69.29 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3947  enoyl-CoA hydratase  69.29 
 
 		 286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0950827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  63.67 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3177  enoyl-CoA hydratase  71.91 
 
 		 284 aa  329  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0869314  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0495  enoyl-CoA hydratase  68.05 
 
 		 284 aa  325  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1204  enoyl-CoA hydratase  63.3 
 
 		 277 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 277 aa  235  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 270 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3098  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 		 260 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.05 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  28.85 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.57 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 261 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 261 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.66 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  31.92 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  33.99 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.92 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.75 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  31.33 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.83 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.44 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 		 270 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>