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for query gene Pden_4241 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 396 aa  752    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  48.08 
 
 		 399 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  51.69 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  49.23 
 
 		 399 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.12 
 
 		 403 aa  328  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  47.98 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.4 
 
 		 412 aa  315  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.4 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  49.19 
 
 		 396 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.45 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.18 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.92 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.47 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.18 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.21 
 
 		 398 aa  239  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.19 
 
 		 404 aa  229  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.95 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.33 
 
 		 424 aa  225  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.48 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.55 
 
 		 414 aa  222  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.39 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  38.36 
 
 		 392 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  38.36 
 
 		 392 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.05 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  39.48 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  37.07 
 
 		 398 aa  215  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.29 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.83 
 
 		 412 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.93 
 
 		 408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.6 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.42 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.36 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.34 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.84 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.84 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.84 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  34.83 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.48 
 
 		 425 aa  209  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.92 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  34.92 
 
 		 426 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.66 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.73 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.73 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_009832  Spro_1190  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.41 
 
 		 396 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.39 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.16 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.31 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.78 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
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NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.29 
 
 		 457 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.26 
 
 		 414 aa  203  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.45 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
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NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.45 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  36.56 
 
 		 416 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.51 
 
 		 437 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  36.03 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.56 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.76 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.04 
 
 		 418 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.68 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.19 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.19 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.92 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  33.8 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.47 
 
 		 398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.73 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.73 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.41 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.73 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.73 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  35.73 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  35.73 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.11 
 
 		 438 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.2 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.57 
 
 		 413 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal  1 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.61 
 
 		 403 aa  195  9e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  35.53 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.93 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.53 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1389  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.93 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0010399  normal  0.0253639 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.5 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.1 
 
 		 398 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.32 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  34.83 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.69 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.47 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.3 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.11 
 
 		 409 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.13 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.11 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.34 
 
 		 400 aa  192  6e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.9 
 
 		 406 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.37 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.39 
 
 		 399 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  38.95 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.15 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.68 
 
 		 416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.38 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.77 
 
 		 400 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.58 
 
 		 419 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  35.68 
 
 		 416 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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