More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2041 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2041  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 
390 aa  790    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2008  acetylornithine transaminase protein  76.86 
 
 
393 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3105  acetylornithine transaminase protein  77.02 
 
 
393 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.0590877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0718  acetylornithine transaminase protein  77.12 
 
 
393 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  0.261062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  69.9 
 
 
391 aa  567  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  68.88 
 
 
393 aa  541  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  62.4 
 
 
395 aa  508  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.61 
 
 
397 aa  474  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.1 
 
 
397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  58.47 
 
 
399 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0402  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  60 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.74 
 
 
396 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.96 
 
 
396 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.96 
 
 
396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  59.48 
 
 
396 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  56.69 
 
 
403 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  56.81 
 
 
402 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0175  acetylornithine transaminase protein  58.47 
 
 
399 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0301  acetylornithine transaminase protein  56.28 
 
 
403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  56.88 
 
 
402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0314  acetylornithine transaminase protein  56.28 
 
 
403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  55.5 
 
 
401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0150  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.06 
 
 
405 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  54.05 
 
 
403 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0127  acetylornithine transaminase protein  59.79 
 
 
399 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0759  acetylornithine transaminase protein  54.38 
 
 
403 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  55.35 
 
 
405 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0513  acetylornithine transaminase protein  53.11 
 
 
403 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.508573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.98 
 
 
400 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0895  acetylornithine transaminase protein  53.61 
 
 
403 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0783  acetylornithine transaminase protein  52.58 
 
 
407 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0758378  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  52.06 
 
 
401 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  49.6 
 
 
401 aa  402  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0642  acetylornithine transaminase protein  52.84 
 
 
403 aa  401  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1231  acetylornithine transaminase protein  52.36 
 
 
404 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0141843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  51.6 
 
 
398 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1147  acetylornithine aminotransferase  52.6 
 
 
394 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109776  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3141  acetylornithine transaminase protein  52.49 
 
 
397 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2300  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  51.3 
 
 
394 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  51.42 
 
 
396 aa  388  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
396 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0487  acetylornithine aminotransferase  51.02 
 
 
395 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.251081  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1359  acetylornithine transaminase protein  49.09 
 
 
395 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.592193  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.49 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0176  acetylornithine aminotransferase  54.72 
 
 
313 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  45.79 
 
 
396 aa  348  9e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  43.86 
 
 
394 aa  344  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
399 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  46.39 
 
 
402 aa  342  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  46.6 
 
 
391 aa  338  7e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3770  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.81 
 
 
406 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233516 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  44.62 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  44.92 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1832  acetylornithine delta-aminotransferase  45.1 
 
 
405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1109  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.99 
 
 
411 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1283  acetylornithine transaminase protein  43.34 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  44.64 
 
 
423 aa  335  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1434  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.27 
 
 
406 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.845656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  44.06 
 
 
398 aa  335  9e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.87 
 
 
396 aa  334  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3565  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.59 
 
 
405 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209353  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  45.38 
 
 
399 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4481  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.01 
 
 
406 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.593317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  44.5 
 
 
396 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  44.15 
 
 
397 aa  332  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  45.79 
 
 
396 aa  332  9e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  44.03 
 
 
386 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3986  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.49 
 
 
406 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.25 
 
 
406 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  45.67 
 
 
399 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52720  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.25 
 
 
406 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  45.14 
 
 
399 aa  329  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  43.77 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2911  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.39 
 
 
406 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  44.68 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00499  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.22 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  43.58 
 
 
386 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  45.13 
 
 
422 aa  324  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.81 
 
 
413 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  45.19 
 
 
391 aa  324  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.13 
 
 
427 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  42.71 
 
 
418 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.73 
 
 
417 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 
418 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  44.68 
 
 
406 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  40.26 
 
 
386 aa  323  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.78 
 
 
408 aa  322  8e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  43.4 
 
 
427 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.9 
 
 
406 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3616  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.04 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0214  acetylornithine transaminase protein  42.15 
 
 
391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000369674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  45.07 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.15 
 
 
402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  43.9 
 
 
403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  40.78 
 
 
386 aa  319  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.16 
 
 
388 aa  319  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  43.16 
 
 
388 aa  319  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.45 
 
 
385 aa  318  7.999999999999999e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0651  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.78 
 
 
401 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.293343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 
397 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>