141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1874 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
208 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  65.87 
 
 
209 aa  297  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  64.93 
 
 
211 aa  283  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  63.98 
 
 
211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  63.98 
 
 
211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  63.33 
 
 
210 aa  278  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  62.2 
 
 
208 aa  271  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  42.29 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.68 
 
 
206 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  39.13 
 
 
206 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.11 
 
 
208 aa  121  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.92 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  39.01 
 
 
203 aa  118  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  36.76 
 
 
237 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  35.79 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  38.1 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  36.99 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.04 
 
 
235 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  34.74 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  33.71 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  35.2 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  34.38 
 
 
196 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.32 
 
 
211 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  35.75 
 
 
215 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.2 
 
 
206 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.71 
 
 
204 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.07 
 
 
209 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  35.2 
 
 
215 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  33.89 
 
 
223 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  34.64 
 
 
218 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  35.23 
 
 
232 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  35.36 
 
 
209 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  35.36 
 
 
209 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  33.7 
 
 
214 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  32.3 
 
 
176 aa  101  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.16 
 
 
197 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  33.9 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.64 
 
 
200 aa  98.6  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.63 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  33.71 
 
 
176 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  31.72 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  31.72 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  30.22 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.84 
 
 
134 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.18 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  27.84 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  28.31 
 
 
177 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1748  heat shock protein DnaJ-like protein  28.99 
 
 
181 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.405714  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.15 
 
 
297 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 
372 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.89 
 
 
320 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  40.74 
 
 
279 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  37.04 
 
 
318 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  35.59 
 
 
318 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0787  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.82 
 
 
292 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.212048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
374 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  37.04 
 
 
318 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  37.74 
 
 
374 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 
386 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  37.29 
 
 
294 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0974  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.62 
 
 
316 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  36.07 
 
 
385 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  35.59 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  38.46 
 
 
340 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  35.85 
 
 
382 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6365  chaperone DnaJ domain protein  36.54 
 
 
304 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0593575  normal  0.238878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.22 
 
 
334 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 
378 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  33.96 
 
 
377 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
380 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5216  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
404 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
376 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  31.67 
 
 
373 aa  45.1  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  40.38 
 
 
298 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  36.54 
 
 
318 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  32.2 
 
 
372 aa  45.1  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
379 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
379 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6186  chaperone DnaJ domain protein  34.62 
 
 
304 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  35.85 
 
 
374 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 
383 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 
320 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.46 
 
 
316 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  34.62 
 
 
372 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.46 
 
 
289 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.46 
 
 
287 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
393 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.18 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  28.05 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  35.85 
 
 
301 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  38.89 
 
 
376 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7804  putative heat shock protein- DnaJ-like protein  35.29 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108723  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  28.7 
 
 
392 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  36.54 
 
 
386 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
376 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  38.89 
 
 
376 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>