More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1396 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 238 aa  487  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  59.91 
 
 		 225 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  59.91 
 
 		 225 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  59.01 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  53.6 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  54.46 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  52.13 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  48.62 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  41.71 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  39.57 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  40.34 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  40.72 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  40.34 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  40.09 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  35.78 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  37.66 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  32.86 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  35.19 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  34.32 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  32.76 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  30.13 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  30.51 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  30.08 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  30.08 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  29.54 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  29.87 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  32.14 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  34.34 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  35.76 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  33.84 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  33 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  31.47 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  31.03 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  32.99 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  32.53 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  29.29 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  30.69 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  31 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  28 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  26.57 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  28.72 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  29.67 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  35.57 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  30.61 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  27.69 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  28.77 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  34.9 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  31.52 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  30.73 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  27.64 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  32.04 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  28.9 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  25.96 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  32.66 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  36.8 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  33.8 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  30.94 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  29.66 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  29.29 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  26.37 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  31.79 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  25 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  33.11 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  28.31 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  27.09 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  40.78 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  30.38 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  30.38 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  34.96 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  30.26 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  26.83 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  33.33 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  26.42 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  30.46 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  27.4 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  29.17 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  29.49 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  26.42 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  23.83 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  34.33 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  30.88 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  36 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  31.58 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  27.47 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  34.15 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  26.41 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  31.33 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  30.86 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  31.16 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  27.17 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  32.14 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  28.21 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  27.42 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  28.97 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  26.67 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  27.75 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>