More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2954 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  100 
 
 		 484 aa  991    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  51.77 
 
 		 484 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  50 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.38 
 
 		 486 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.96 
 
 		 486 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.75 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  47.75 
 
 		 487 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.96 
 
 		 500 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  47.81 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.34 
 
 		 480 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.24 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.55 
 
 		 481 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  48.01 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.44 
 
 		 497 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.74 
 
 		 478 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.33 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  50.1 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.9 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.74 
 
 		 481 aa  424  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.19 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  44.33 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  42.62 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.79 
 
 		 475 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.83 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  42.62 
 
 		 476 aa  418  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  48.68 
 
 		 493 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  42.62 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  42.62 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  42.2 
 
 		 480 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.9 
 
 		 477 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  43.45 
 
 		 477 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  42.62 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  42.41 
 
 		 498 aa  415  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  42.74 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  42.2 
 
 		 498 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  42.2 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  42.2 
 
 		 498 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.77 
 
 		 482 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.15 
 
 		 486 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.15 
 
 		 486 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.26 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.95 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.95 
 
 		 509 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.27 
 
 		 587 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.41 
 
 		 502 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.03 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.95 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  41.61 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.7 
 
 		 496 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.35 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.24 
 
 		 482 aa  388  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.14 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  45.42 
 
 		 487 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.35 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  40.42 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.8 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  44.74 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.94 
 
 		 507 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.74 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.8 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.59 
 
 		 482 aa  375  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.15 
 
 		 518 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.8 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.25 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.29 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.9 
 
 		 506 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.59 
 
 		 473 aa  371  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.51 
 
 		 508 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.05 
 
 		 493 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  40.08 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.72 
 
 		 497 aa  364  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.83 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  43.24 
 
 		 489 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.39 
 
 		 499 aa  362  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.08 
 
 		 477 aa  360  3e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.14 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.01 
 
 		 481 aa  357  3.9999999999999996e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.74 
 
 		 478 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.29 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 487 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.97 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  42.04 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.75 
 
 		 499 aa  352  1e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  40.53 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.12 
 
 		 467 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.7 
 
 		 503 aa  350  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.79 
 
 		 488 aa  348  9e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  41.86 
 
 		 486 aa  348  9e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  38.13 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  38.16 
 
 		 492 aa  347  4e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  40.95 
 
 		 477 aa  346  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  40.33 
 
 		 477 aa  346  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.48 
 
 		 498 aa  345  7e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  42.94 
 
 		 556 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  42.54 
 
 		 515 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  40.57 
 
 		 484 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.02 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  41.57 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  41.09 
 
 		 483 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>