More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1742 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  100 
 
 		 286 aa  564  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  74.83 
 
 		 286 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  73.78 
 
 		 286 aa  442  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  71.33 
 
 		 286 aa  435  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  35.91 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  35.96 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  33.8 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  35.57 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  29.43 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  29.14 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  29.43 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  28.98 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  29.08 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  29.71 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  29.64 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  26.24 
 
 		 302 aa  92.8  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  27.62 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  29.45 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  27.87 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  27.87 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  27.07 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  27.75 
 
 		 427 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  33.77 
 
 		 177 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.09 
 
 		 903 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  30.67 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  33.06 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  29.66 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  30.83 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  26.97 
 
 		 152 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  32.35 
 
 		 909 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  28.97 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  33.33 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  30.89 
 
 		 909 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  32.45 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1191  DRTGG domain-containing protein  23.53 
 
 		 435 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  25.74 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  26.06 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  25.66 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  26.39 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  33.04 
 
 		 696 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  36.61 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  30.08 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  26.15 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  36.84 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  37.72 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  30.34 
 
 		 151 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  29.27 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  30.67 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  32.46 
 
 		 710 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  37.72 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  30.52 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  30.67 
 
 		 177 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  26.85 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  30 
 
 		 177 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  27.73 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0477  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.23 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  28.22 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  28.83 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  28.83 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  25.34 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  28.22 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.73 
 
 		 907 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  34.45 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  29.8 
 
 		 177 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.64 
 
 		 488 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  28.69 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  30.82 
 
 		 150 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  30.16 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0546  putative signal-transduction protein with CBS and DRTGG domains  28.07 
 
 		 434 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  30.5 
 
 		 154 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  41.89 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  31.85 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  25.52 
 
 		 153 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  30.71 
 
 		 425 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.82 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  25.79 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  25.52 
 
 		 153 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.32 
 
 		 161 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  25.9 
 
 		 428 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  31.72 
 
 		 177 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  28.22 
 
 		 391 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  28.47 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  26.71 
 
 		 150 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  32.5 
 
 		 132 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  30.08 
 
 		 393 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  25.22 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  30.36 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  34.83 
 
 		 593 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  29.41 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  28.83 
 
 		 391 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  28.28 
 
 		 151 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0432  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.14 
 
 		 494 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  26.8 
 
 		 436 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>