130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1710 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1710  siroheme synthase  100 
 
 		 212 aa  417  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1896  siroheme synthase  71.29 
 
 		 217 aa  300  1e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.105096 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0119  siroheme synthase  65.09 
 
 		 283 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2248  siroheme synthase  66.98 
 
 		 215 aa  265  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0893363  normal  0.464998 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1731  siroheme synthase  36.74 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.381088  normal  0.846654 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1159  siroheme synthase  27.05 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.403167  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0213  siroheme synthase  31.34 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000389168  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  30.46 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  32.97 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  28.27 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  31.22 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  31.22 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.96 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  25.7 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  26.56 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  29.92 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  26.18 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  27.14 
 
 		 303 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  26.04 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  36.69 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  28.95 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.84 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  25.82 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  26.67 
 
 		 468 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  27.47 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.57 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  27.48 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.88 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  26.84 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  31.49 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  28.96 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  28.42 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  29.44 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  30.2 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1423  precorrin-2 dehydrogenase  27.13 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.747148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  26.88 
 
 		 464 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  26.34 
 
 		 464 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1689  precorrin-2 dehydrogenase  26.15 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.428114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  25.4 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.07 
 
 		 480 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  26.37 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  26.37 
 
 		 303 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  25.76 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  26.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  25.82 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.49 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  24.24 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  23.19 
 
 		 462 aa  55.5  0.0000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.97 
 
 		 480 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  26.26 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1729  siroheme synthase  30.96 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1755  siroheme synthase  30.84 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  24.86 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  25.14 
 
 		 306 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  25.4 
 
 		 459 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.32 
 
 		 489 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  23.91 
 
 		 306 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  20.29 
 
 		 321 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  24.15 
 
 		 472 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  24.15 
 
 		 472 aa  52  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.15 
 
 		 472 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  34.13 
 
 		 490 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  24.55 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.07 
 
 		 493 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.5 
 
 		 528 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  22.93 
 
 		 472 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.18 
 
 		 484 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  30.08 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.42 
 
 		 473 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  28 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  27.63 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  29.41 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  23.12 
 
 		 188 aa  49.7  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.94 
 
 		 495 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  22.04 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.66 
 
 		 479 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.47 
 
 		 487 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  30.21 
 
 		 407 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.67 
 
 		 473 aa  48.1  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  22.47 
 
 		 554 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.41 
 
 		 462 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  27.92 
 
 		 303 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  25 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  22.22 
 
 		 467 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  23.66 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  22.52 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  28.92 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.14 
 
 		 464 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  24.26 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.97 
 
 		 778 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1844  siroheme synthase  23.62 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  26.92 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  31.78 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  27.07 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2129  siroheme synthase  37.17 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  22.49 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  23.64 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  26.87 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1506  siroheme synthase  23.24 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.54 
 
 		 837 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>