146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1016 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1016  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1288  hydrolase  77.34 
 
 		 208 aa  325  2.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1830  hydrolase  74.26 
 
 		 208 aa  318  3e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.797395  hitchhiker  0.00000000137231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2080  hydrolase  75.25 
 
 		 208 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0798472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1212  phosphoserine phosphatase-like hydrolase  34.12 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0825  phosphoserine phosphatase-like hydrolase  29.41 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0827  phosphoserine phosphatase-like hydrolase  25.79 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  31.55 
 
 		 406 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  32.14 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  36.59 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  33.11 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  32.32 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  33.09 
 
 		 404 aa  58.9  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  33.86 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  28.18 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  34.11 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  30.99 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  34.11 
 
 		 418 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  32.28 
 
 		 418 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  26.6 
 
 		 398 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  33.07 
 
 		 415 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  28.07 
 
 		 412 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  32.56 
 
 		 404 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  33.55 
 
 		 398 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  33.07 
 
 		 404 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  33.07 
 
 		 429 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  28.9 
 
 		 410 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  28.87 
 
 		 429 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  33.81 
 
 		 299 aa  52.8  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  29.85 
 
 		 409 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  31.91 
 
 		 413 aa  52.4  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1094  phosphoserine phosphatase  32.39 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  35.76 
 
 		 298 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  32.62 
 
 		 411 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  33.07 
 
 		 404 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  36.77 
 
 		 296 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  26.06 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1367  3-phosphoserine phosphatase  28.93 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  32.37 
 
 		 299 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  32.17 
 
 		 404 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2446  HAD superfamily hydrolase  31.25 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  30.95 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  33.04 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  33.33 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  26.27 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  31.47 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  30.95 
 
 		 298 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1886  phosphoserine phosphatase SerB  28.67 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  33.9 
 
 		 325 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  31.48 
 
 		 419 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  31.75 
 
 		 309 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  31.86 
 
 		 294 aa  48.5  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  32.94 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  34.88 
 
 		 414 aa  48.5  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  26.67 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  31.41 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  26.04 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  29.17 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  29.82 
 
 		 405 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  32.2 
 
 		 325 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  34.11 
 
 		 406 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  31.14 
 
 		 400 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  34.38 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  29.37 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  34.38 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  33.58 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2546  phosphoserine phosphatase SerB  27.2 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1580  Cof-like hydrolase  44.64 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2388  phosphoserine phosphatase SerB  27.2 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.361325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  34.19 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  29.24 
 
 		 405 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2343  phosphoserine phosphatase SerB  27.2 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843951  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  29.24 
 
 		 405 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  30.28 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  30.77 
 
 		 410 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0070  phosphoserine phosphatase SerB  30.07 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  27.64 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  32.2 
 
 		 325 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  31.14 
 
 		 400 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  30 
 
 		 432 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  35.11 
 
 		 299 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0153  3-deoxy-D-manno-octulosonate 8-phosphate phosphatase  40 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  30.97 
 
 		 410 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2436  phosphoserine phosphatase SerB  27.2 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  32.89 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2432  phosphoserine phosphatase SerB  27.2 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  28.05 
 
 		 302 aa  45.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  29.73 
 
 		 291 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  31.11 
 
 		 326 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  33.58 
 
 		 299 aa  45.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_002950  PG1170  SerB family protein  30.23 
 
 		 290 aa  45.1  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  30.43 
 
 		 297 aa  45.1  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  32.03 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  29.8 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  29.8 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  27.17 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0333  phosphoserine phosphatase SerB  41.38 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  27.14 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1659  phosphoserine phosphatase SerB  25.6 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00929582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  30.3 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>