124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1001 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1001  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 363 aa  716    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1777  nucleotidyl transferase  72.38 
 
 		 363 aa  543  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13003  normal  0.0200486 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0427  nucleotidyl transferase  69.34 
 
 		 363 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1694  nucleotidyl transferase  69.61 
 
 		 363 aa  524  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00229332  normal  0.012326 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0086  sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.33 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.387197  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0529  hexapaptide repeat-containing transferase  35.31 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1604  nucleotidyl transferase  29.08 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0798438  normal  0.128956 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1356  Nucleotidyl transferase  28.76 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  25.91 
 
 		 403 aa  93.6  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  26.64 
 
 		 400 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  24.18 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.07 
 
 		 397 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  23.12 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.43 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  23.96 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  28.99 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  26.16 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  28 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  25.08 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  26.43 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.58 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  37.98 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  24.06 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  30.64 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.51 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  23.34 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  31.98 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  23.26 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23.2 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  22.69 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  23.04 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  25.44 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  22.96 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  24.18 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.27 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.91 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  20.06 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  26.57 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.33 
 
 		 224 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  24.25 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.27 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  25.15 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.21 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  28.11 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  22.36 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  24.43 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  22.32 
 
 		 818 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  22.02 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0275  putative acyltransferase  30.72 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  22.67 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.47 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.6 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  28.67 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  24.18 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  30.71 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  31.45 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  31.4 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  29.32 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2516  Nucleotidyl transferase  32.72 
 
 		 388 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  22.35 
 
 		 828 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  26.35 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  26.4 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  24.68 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.73 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.07 
 
 		 269 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3185  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  28.69 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  27.63 
 
 		 243 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  25.22 
 
 		 238 aa  49.3  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4080  transferase; LpxA family  25.52 
 
 		 212 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  20.96 
 
 		 820 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  28.69 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  22.15 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  27.65 
 
 		 232 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.48 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  29.31 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  24.14 
 
 		 236 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  22.93 
 
 		 361 aa  47  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  27.11 
 
 		 227 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  20.87 
 
 		 776 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.15 
 
 		 357 aa  46.6  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  20.98 
 
 		 354 aa  46.2  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.72 
 
 		 355 aa  46.2  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  28.45 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  22.7 
 
 		 209 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2353  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  39.34 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.73 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.66 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.23 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  31.07 
 
 		 843 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.21 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.1 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.66 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  23.86 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0894  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.48 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  20.14 
 
 		 820 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.4 
 
 		 828 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>