More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0166 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  60.35 
 
 		 608 aa  734    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0166  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 623 aa  1250    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  55.22 
 
 		 608 aa  650    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0200095  normal  0.25307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  48.61 
 
 		 663 aa  555  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  46.88 
 
 		 642 aa  549  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  46.64 
 
 		 641 aa  534  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  41.85 
 
 		 646 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  41.54 
 
 		 646 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  41.85 
 
 		 646 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  41.69 
 
 		 646 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  41.85 
 
 		 646 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  41.69 
 
 		 646 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  41.69 
 
 		 646 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  41.85 
 
 		 646 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  41.69 
 
 		 646 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  41.54 
 
 		 646 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 		 646 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  42.94 
 
 		 670 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  40.55 
 
 		 668 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 694 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 674 aa  415  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 643 aa  415  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 		 670 aa  414  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 		 663 aa  411  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  41.57 
 
 		 638 aa  405  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1428  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 		 640 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922087  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6401  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 		 640 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  40.51 
 
 		 667 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7333  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 		 650 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  41.52 
 
 		 666 aa  397  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 641 aa  394  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  38.26 
 
 		 670 aa  394  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1821  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 		 652 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  39.19 
 
 		 639 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  38.81 
 
 		 668 aa  373  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  36.79 
 
 		 650 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  38.46 
 
 		 656 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  36.64 
 
 		 650 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  38.68 
 
 		 639 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  36.01 
 
 		 660 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  38.18 
 
 		 631 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  37.07 
 
 		 659 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  37.84 
 
 		 666 aa  365  1e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  38.75 
 
 		 666 aa  365  1e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  37.26 
 
 		 631 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  38.84 
 
 		 670 aa  365  1e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  37.89 
 
 		 648 aa  364  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  35.28 
 
 		 635 aa  365  2e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  35.74 
 
 		 653 aa  363  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 652 aa  363  7.0000000000000005e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6450  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 650 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  hitchhiker  0.0000000000000110833 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  35.96 
 
 		 638 aa  362  1e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  36.99 
 
 		 632 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  36.82 
 
 		 632 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  37.22 
 
 		 644 aa  360  5e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  36.54 
 
 		 632 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  36 
 
 		 636 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  37.5 
 
 		 656 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  35.11 
 
 		 664 aa  356  5e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  36.62 
 
 		 632 aa  356  7.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  35.5 
 
 		 636 aa  353  4e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  35.56 
 
 		 649 aa  353  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  35.87 
 
 		 661 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  37.11 
 
 		 651 aa  350  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  37 
 
 		 652 aa  350  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  36.41 
 
 		 667 aa  349  8e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  35.43 
 
 		 648 aa  349  9e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  35.63 
 
 		 652 aa  349  9e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  35.52 
 
 		 661 aa  348  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  35.15 
 
 		 643 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  35.42 
 
 		 660 aa  347  5e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  37.99 
 
 		 629 aa  346  8e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  36.58 
 
 		 632 aa  346  8.999999999999999e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  36.14 
 
 		 654 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  34.67 
 
 		 636 aa  343  5e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  36.61 
 
 		 651 aa  343  5e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  35.62 
 
 		 629 aa  343  7e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  36.3 
 
 		 649 aa  342  9e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  35.06 
 
 		 657 aa  342  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  35.83 
 
 		 626 aa  342  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  35.74 
 
 		 652 aa  342  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  34.65 
 
 		 652 aa  342  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  36.68 
 
 		 692 aa  340  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  35.46 
 
 		 664 aa  340  5e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00711  acetyl-coenzyme A synthetase (Acetate--CoA ligase) (Acyl-activating enzyme)  36.02 
 
 		 648 aa  339  7e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  34.53 
 
 		 656 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  36 
 
 		 655 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  36.61 
 
 		 646 aa  338  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  35.23 
 
 		 645 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  36 
 
 		 655 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  36.74 
 
 		 661 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  37.21 
 
 		 650 aa  338  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  36.12 
 
 		 654 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1711  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 		 653 aa  336  5.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.103973  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  35.46 
 
 		 657 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  34.71 
 
 		 629 aa  335  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 661 aa  335  1e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 627 aa  335  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  35.2 
 
 		 664 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  34.78 
 
 		 655 aa  334  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>