More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4047 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4047  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 447 aa  926    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3967  AMP-dependent synthetase and ligase  53.36 
 
 		 447 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.923272  normal  0.0394514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1127  AMP-dependent synthetase and ligase  52.47 
 
 		 447 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0813  AMP-dependent synthetase and ligase  52.63 
 
 		 449 aa  458  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3063  AMP-dependent synthetase and ligase  40.05 
 
 		 446 aa  328  9e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214783  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3791  AMP-dependent synthetase and ligase  39.42 
 
 		 446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.636512 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3895  hypothetical protein  41.79 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1426  AMP-dependent synthetase and ligase  38.44 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.745476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1373  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.31 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  26.79 
 
 		 518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 508 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  24.95 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  24.95 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  26.24 
 
 		 508 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.67 
 
 		 523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  24.75 
 
 		 511 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 		 524 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 		 495 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3072  hypothetical protein  28.16 
 
 		 448 aa  114  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  24.69 
 
 		 496 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 519 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  24.54 
 
 		 496 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 490 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1028  putative AMP-dependent synthetase and ligase  23.27 
 
 		 530 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0219794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10100  acyl-CoA synthetase  26.68 
 
 		 540 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.935703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 		 515 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 		 515 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 552 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  26.26 
 
 		 662 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 770 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.49 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.97 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.52 
 
 		 490 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.49 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.49 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.14 
 
 		 510 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.49 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.49 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.49 
 
 		 510 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 505 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.99 
 
 		 510 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.49 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 532 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.7 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 		 496 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.19 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 506 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 506 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.24 
 
 		 506 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.18 
 
 		 477 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  25.95 
 
 		 531 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 		 553 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  23.34 
 
 		 511 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.25 
 
 		 514 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  25.15 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  24.39 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.09 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  26.67 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29237  predicted protein  27.33 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  23.95 
 
 		 516 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2354  putative acetyl-CoA synthetase  24.57 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.804997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6726  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 473 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149024  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  26.61 
 
 		 553 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  26.92 
 
 		 537 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  26.35 
 
 		 518 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  26.92 
 
 		 537 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  26.92 
 
 		 537 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.02 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.02 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 		 514 aa  103  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 520 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 		 502 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  25.74 
 
 		 518 aa  103  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  25.75 
 
 		 518 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1366  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.19 
 
 		 485 aa  103  9e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.691182  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 		 512 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  26.92 
 
 		 557 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  26.3 
 
 		 560 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 542 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 584 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  27.17 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3351  AMP-dependent synthetase and ligase  23.65 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.06 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.49 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4529  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 529 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 		 573 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  26.87 
 
 		 549 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  25.44 
 
 		 498 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  27.25 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  25.15 
 
 		 521 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.96 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 		 517 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  25.75 
 
 		 518 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>