More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2418 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 570 aa  1192    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  43.66 
 
 		 610 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  43.13 
 
 		 589 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  42.44 
 
 		 590 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  40.49 
 
 		 591 aa  451  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  37.79 
 
 		 574 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 		 596 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 		 577 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  36.78 
 
 		 571 aa  398  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  37.32 
 
 		 571 aa  399  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  36.61 
 
 		 580 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 606 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 		 599 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 596 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 		 572 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  34.4 
 
 		 569 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  35.7 
 
 		 621 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  35.23 
 
 		 579 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 574 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 574 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 		 577 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 		 585 aa  361  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  35.97 
 
 		 574 aa  360  5e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 		 586 aa  346  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  32.99 
 
 		 576 aa  339  8e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 		 576 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  32.97 
 
 		 556 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  33.21 
 
 		 554 aa  280  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  33.27 
 
 		 559 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  32.44 
 
 		 556 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 		 605 aa  273  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  31.66 
 
 		 553 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  31.9 
 
 		 556 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  31.73 
 
 		 529 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  31.79 
 
 		 555 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  31.43 
 
 		 556 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  31.03 
 
 		 594 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  31.14 
 
 		 555 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 		 548 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 		 573 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  29.75 
 
 		 571 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  31.07 
 
 		 562 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  31.2 
 
 		 533 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  31.04 
 
 		 595 aa  243  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  30.44 
 
 		 582 aa  232  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  28.05 
 
 		 565 aa  223  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  29.64 
 
 		 563 aa  220  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  26.47 
 
 		 667 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  26.7 
 
 		 580 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  26.02 
 
 		 700 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.56 
 
 		 627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.14 
 
 		 661 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 		 625 aa  130  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.73 
 
 		 666 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 703 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  31.97 
 
 		 403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.67 
 
 		 718 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.63 
 
 		 650 aa  127  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.14 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.18 
 
 		 607 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  30.42 
 
 		 636 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.31 
 
 		 653 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  29.85 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.42 
 
 		 598 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.14 
 
 		 715 aa  123  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.72 
 
 		 850 aa  123  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 		 612 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 651 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.26 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  26.98 
 
 		 634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.63 
 
 		 662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  27.72 
 
 		 658 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 479 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.72 
 
 		 1023 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.85 
 
 		 641 aa  120  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  26.79 
 
 		 325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.62 
 
 		 632 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.84 
 
 		 594 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 666 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.13 
 
 		 728 aa  120  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  28.16 
 
 		 623 aa  120  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.44 
 
 		 747 aa  120  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  30.89 
 
 		 399 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  29.08 
 
 		 455 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.74 
 
 		 668 aa  120  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.67 
 
 		 584 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.28 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.77 
 
 		 696 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 		 691 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  27.11 
 
 		 618 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 		 683 aa  119  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 466 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>