96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0482 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0138  paraquat-inducible protein A  30.24 
 
 		 222 aa  86.3  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3870  paraquat-inducible protein A  32.65 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3492  paraquat-inducible protein A  29.9 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0101  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3953  paraquat-inducible protein A  30.61 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0097  paraquat-inducible protein A  31.29 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4443  paraquat-inducible protein A  31.29 
 
 		 211 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4248  Paraquat-inducible protein A  31.65 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4303  paraquat-inducible protein A  31.65 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3860  paraquat-inducible protein A  30.61 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4068  hypothetical protein  29.93 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3907  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0283  hypothetical protein  35.56 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4710  hypothetical protein  30.22 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1153  paraquat-inducible protein A  35.09 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.393149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  29.27 
 
 		 402 aa  51.6  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  31.36 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  37.35 
 
 		 422 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  28.46 
 
 		 449 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  29.51 
 
 		 423 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  28.81 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  30.77 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  30.77 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  30.77 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  30.77 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  28.81 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  31.4 
 
 		 380 aa  48.5  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  31.43 
 
 		 415 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  30.77 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  31.43 
 
 		 450 aa  48.5  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  31.43 
 
 		 450 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  30.23 
 
 		 220 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  30 
 
 		 252 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  28.69 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  31.54 
 
 		 434 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  28.69 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  28.69 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  28.69 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  28.69 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  28.46 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  28.69 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  25.62 
 
 		 405 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  28.69 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  28.46 
 
 		 417 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  27.5 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  31.91 
 
 		 417 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  35 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  31.91 
 
 		 417 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  31.91 
 
 		 417 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  31.91 
 
 		 417 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  31.91 
 
 		 417 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  33.7 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  27.64 
 
 		 417 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  33.33 
 
 		 422 aa  45.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  29.03 
 
 		 426 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  26.83 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  27.94 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  34.07 
 
 		 426 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  34.07 
 
 		 426 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2083  paraquat-inducible protein A  38.46 
 
 		 420 aa  44.7  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  30.59 
 
 		 249 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  32.53 
 
 		 207 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  31.67 
 
 		 204 aa  44.3  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  31.58 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  35 
 
 		 449 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30331  predicted protein  28.06 
 
 		 1179 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  29.66 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  29.35 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  29.35 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  29.66 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  31.52 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  29.66 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  29.35 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  28.93 
 
 		 423 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  27.35 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  29.35 
 
 		 209 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  30.68 
 
 		 448 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  29.36 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  32.97 
 
 		 427 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  29.35 
 
 		 209 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  30.23 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  29.51 
 
 		 458 aa  42  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  28.26 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  27.78 
 
 		 401 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  30.48 
 
 		 201 aa  42  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1994  paraquat-inducible protein A  30.94 
 
 		 199 aa  42  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.338034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45216  hypothetical protein  28.24 
 
 		 430 aa  41.6  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  26.27 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3076  Paraquat-inducible protein A  31.63 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  28.74 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  27.13 
 
 		 245 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  28.16 
 
 		 427 aa  41.2  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  30.63 
 
 		 416 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  27.13 
 
 		 245 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  27.27 
 
 		 417 aa  40.8  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>