82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1994 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1994  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.338034  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  30.95 
 
 
423 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  29.75 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  29.7 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  28.57 
 
 
402 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  34.92 
 
 
449 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1153  paraquat-inducible protein A  29.52 
 
 
167 aa  55.1  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.393149 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  28.29 
 
 
464 aa  55.1  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  28.85 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  28.85 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  29.75 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  29.87 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  28.85 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  28.95 
 
 
449 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  32.8 
 
 
224 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  29.45 
 
 
207 aa  52  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  30.66 
 
 
219 aa  51.6  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  27.4 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  32.47 
 
 
417 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  32.47 
 
 
417 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  32.47 
 
 
417 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  32.47 
 
 
417 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  32.47 
 
 
417 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  27.56 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.123343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  32.41 
 
 
417 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  32.41 
 
 
417 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  32.41 
 
 
417 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  27.92 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  32.41 
 
 
417 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  32.41 
 
 
417 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  32.41 
 
 
417 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  32.41 
 
 
417 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  32.41 
 
 
417 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  32.41 
 
 
417 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  30.77 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  28.28 
 
 
428 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  28.28 
 
 
428 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  27.27 
 
 
413 aa  48.9  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  29.87 
 
 
209 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  28.28 
 
 
428 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  24.87 
 
 
434 aa  48.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  28.49 
 
 
422 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  32.45 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  26.74 
 
 
415 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  28.57 
 
 
415 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  28.28 
 
 
414 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  28.99 
 
 
220 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3333  hypothetical protein  29.93 
 
 
162 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3907  paraquat-inducible protein A  33.08 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  29.03 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  30.52 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3870  paraquat-inducible protein A  40.23 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  30.13 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  30.3 
 
 
212 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  29.85 
 
 
422 aa  45.1  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  28 
 
 
423 aa  44.7  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  31.29 
 
 
417 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5823  paraquat-inducible protein A  29.33 
 
 
401 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  27.65 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  27.65 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  30.13 
 
 
460 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  30.7 
 
 
405 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  30.13 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  27.39 
 
 
458 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  26.75 
 
 
448 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  29.87 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  27.75 
 
 
444 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  23.24 
 
 
426 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  23.24 
 
 
427 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  23.24 
 
 
426 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  25.64 
 
 
380 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3492  paraquat-inducible protein A  31.58 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  27.5 
 
 
215 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0101  paraquat-inducible protein A  35.79 
 
 
219 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0138  paraquat-inducible protein A  34.62 
 
 
222 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  28.93 
 
 
489 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3076  Paraquat-inducible protein A  35.45 
 
 
155 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  30.94 
 
 
181 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  28.89 
 
 
209 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  28.89 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>