27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3870 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3870  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4443  paraquat-inducible protein A  91.3 
 
 		 211 aa  361  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0097  paraquat-inducible protein A  91.3 
 
 		 211 aa  361  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4303  paraquat-inducible protein A  90.82 
 
 		 211 aa  359  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4248  Paraquat-inducible protein A  90.82 
 
 		 211 aa  359  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4068  hypothetical protein  84.13 
 
 		 211 aa  328  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3953  paraquat-inducible protein A  83.07 
 
 		 211 aa  328  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3860  paraquat-inducible protein A  83.07 
 
 		 211 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4710  hypothetical protein  83.07 
 
 		 230 aa  324  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0138  paraquat-inducible protein A  58.62 
 
 		 222 aa  241  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0101  paraquat-inducible protein A  61.75 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3907  paraquat-inducible protein A  48.86 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0283  hypothetical protein  45.65 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3492  paraquat-inducible protein A  43.39 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  32.65 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  30 
 
 		 380 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1994  paraquat-inducible protein A  40.23 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.338034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1153  paraquat-inducible protein A  30.89 
 
 		 167 aa  44.7  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.393149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  29.17 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  34.15 
 
 		 449 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  30.25 
 
 		 450 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  30.25 
 
 		 450 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  30.25 
 
 		 415 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 249 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3076  Paraquat-inducible protein A  29.2 
 
 		 155 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  35.37 
 
 		 462 aa  41.2  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  35.62 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>