41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4710 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4710  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4068  hypothetical protein  90.52 
 
 		 211 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3860  paraquat-inducible protein A  91 
 
 		 211 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3953  paraquat-inducible protein A  90.52 
 
 		 211 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3870  paraquat-inducible protein A  81.07 
 
 		 207 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0097  paraquat-inducible protein A  82.46 
 
 		 211 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4248  Paraquat-inducible protein A  82.46 
 
 		 211 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4303  paraquat-inducible protein A  82.46 
 
 		 211 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4443  paraquat-inducible protein A  81.99 
 
 		 211 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0138  paraquat-inducible protein A  59 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0101  paraquat-inducible protein A  61.75 
 
 		 219 aa  234  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3907  paraquat-inducible protein A  47.73 
 
 		 188 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3492  paraquat-inducible protein A  41.27 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0283  hypothetical protein  41.3 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  27.18 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  32.58 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  33.71 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  29.41 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  30.43 
 
 		 426 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  30.43 
 
 		 426 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  36.49 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  33.33 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  30.86 
 
 		 380 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  27.06 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  29.87 
 
 		 449 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  28.24 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45216  hypothetical protein  30.23 
 
 		 430 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  32.94 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0132  paraquat-inducible protein A  30.33 
 
 		 178 aa  42.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246044  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  32.14 
 
 		 417 aa  42.4  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  30.23 
 
 		 209 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  30.23 
 
 		 209 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  28.24 
 
 		 216 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  31.71 
 
 		 220 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1153  paraquat-inducible protein A  28.44 
 
 		 167 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.393149 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  29.21 
 
 		 212 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  31.17 
 
 		 462 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  31.76 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  30.34 
 
 		 449 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  31.76 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  31.76 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>