45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3953 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3953  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4068  hypothetical protein  98.1 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3860  paraquat-inducible protein A  99.05 
 
 		 211 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4710  hypothetical protein  90.52 
 
 		 230 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0097  paraquat-inducible protein A  84.36 
 
 		 211 aa  346  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3870  paraquat-inducible protein A  81.86 
 
 		 207 aa  345  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4443  paraquat-inducible protein A  83.89 
 
 		 211 aa  344  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4303  paraquat-inducible protein A  83.89 
 
 		 211 aa  344  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4248  Paraquat-inducible protein A  83.89 
 
 		 211 aa  344  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0138  paraquat-inducible protein A  59.41 
 
 		 222 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0101  paraquat-inducible protein A  62.84 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3907  paraquat-inducible protein A  48.86 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0283  hypothetical protein  44.57 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3492  paraquat-inducible protein A  44.92 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  27.67 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  38.04 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  34.78 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  30.07 
 
 		 426 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  30.07 
 
 		 426 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  32.47 
 
 		 449 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  29.2 
 
 		 427 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  32.47 
 
 		 380 aa  45.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  33.77 
 
 		 462 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1153  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 167 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.393149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  29.27 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  30.49 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  31.76 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  31.76 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  30.49 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  28.35 
 
 		 415 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  28.35 
 
 		 450 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  28.35 
 
 		 450 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  32.94 
 
 		 209 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  34.94 
 
 		 247 aa  42  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  30.86 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  34.62 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  31.71 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  29.41 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>