33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1879 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1309  Alpha-amylase  80.92 
 
 		 457 aa  789    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.485792  normal  0.72341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1879  Alpha-amylase  100 
 
 		 456 aa  934    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0969  Alpha-amylase  78.73 
 
 		 457 aa  776    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1039  Alpha-amylase  81.88 
 
 		 457 aa  773    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132499 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  50.88 
 
 		 518 aa  394  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  44.92 
 
 		 495 aa  330  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0437  Alpha-amylase  45.48 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1537  Alpha-amylase  40.86 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.856443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  44.62 
 
 		 448 aa  312  7.999999999999999e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  44.19 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  40.71 
 
 		 407 aa  306  6e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  40.41 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  40.66 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  40.41 
 
 		 407 aa  298  9e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1418  Alpha-amylase  42.24 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00043111  hitchhiker  0.00411269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0836  Alpha-amylase  41.88 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.788562  normal  0.0580131 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  37.47 
 
 		 580 aa  280  5e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  37.72 
 
 		 447 aa  279  6e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0801  a-amylase, glycoside hydrolase family 57 protein  39.65 
 
 		 397 aa  269  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00227308 
 
 
-
 
NC_002950  PG1683  hypothetical protein  37.15 
 
 		 428 aa  254  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0469  Alpha-amylase  37.37 
 
 		 487 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.763959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0985  Alpha-amylase  34.79 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.70753  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1868  glycoside hydrolase family 57  29.04 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.894026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1267  Alpha-amylase  30.91 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.365279  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0436  glycoside hydrolase family protein  30.31 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0527486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0537  alpha-amylase  29.19 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0998  4-alpha-glucanotransferase  19.93 
 
 		 672 aa  51.2  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  28.86 
 
 		 749 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  28.86 
 
 		 749 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  22.77 
 
 		 743 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0531  glycoside hydrolase family 57  19.71 
 
 		 361 aa  44.7  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 485 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  21.05 
 
 		 744 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>