149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1610 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1610  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1824  radical SAM domain-containing protein  78.66 
 
 		 261 aa  415  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0456  radical SAM domain-containing protein  74.41 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1664  radical SAM domain-containing protein  74.8 
 
 		 254 aa  384  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1582  radical SAM domain-containing protein  46.22 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1832  radical SAM domain-containing protein  35.84 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0246453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1795  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2633  Radical SAM domain protein  33.12 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 482 aa  55.8  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3065  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.15 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  31.78 
 
 		 422 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  31.78 
 
 		 422 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 446 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 429 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5047  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.25 
 
 		 353 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  32.65 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 482 aa  53.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  28.85 
 
 		 471 aa  52.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 357 aa  52.4  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 356 aa  52  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  31.13 
 
 		 462 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  32.62 
 
 		 396 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.79 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 451 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 		 450 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.58 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.79 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 482 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  28.66 
 
 		 465 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 405 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 446 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 382 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.91 
 
 		 337 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  34.03 
 
 		 410 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 380 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  31.37 
 
 		 482 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.29 
 
 		 316 aa  49.7  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.19 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  33.1 
 
 		 365 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 		 364 aa  49.3  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 328 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 362 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  29.45 
 
 		 479 aa  48.9  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 332 aa  48.5  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 460 aa  48.9  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  33.64 
 
 		 371 aa  48.5  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  26.15 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  34.86 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.56 
 
 		 319 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.14 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.7 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 458 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 410 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  24.82 
 
 		 461 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.17 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.17 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 		 368 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.62 
 
 		 323 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.65 
 
 		 349 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.04 
 
 		 341 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  30.09 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.07 
 
 		 297 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  26.95 
 
 		 363 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 347 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.48 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4668  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.14 
 
 		 326 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.2 
 
 		 350 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 395 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1705  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.28 
 
 		 353 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.71 
 
 		 387 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  32.14 
 
 		 387 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0404  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 458 aa  45.4  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23971 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.99 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.39 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 462 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  29.79 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  28.7 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.5 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.11 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.62 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0823  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.72 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0317783  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0611  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.17 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.14 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 486 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  40.48 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0308  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.65 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.03 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.5 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.14 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.38 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 460 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>