47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1065 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  259  6e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  42.62 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  43.44 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  42.14 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2713  PilT protein domain protein  31.36 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0839377  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  32.5 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  39.02 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  41.41 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  37.1 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1017  hypothetical protein  36.67 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.504321  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  33.85 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2777  PilT protein domain protein  31.45 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.293295  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  34.15 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2206  PilT protein domain protein  29.84 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.364897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  29.29 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1436  hypothetical protein  42.39 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0608758  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  37.11 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  37.21 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  34.96 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  35.16 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0894  PilT protein domain protein  34.96 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  31.06 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  41.54 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  35.65 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2491  PilT protein domain protein  37.14 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.170023  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  38.69 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  29.03 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  36.14 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0411  PilT domain-containing protein  32.81 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  30.88 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  25 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0338  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.4702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  34.4 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  34.41 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  33.85 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3094  PilT protein domain protein  34.38 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.492966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  32.23 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  28.35 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  34.13 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0599  hypothetical protein  35.96 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.459839  normal  0.795702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  31.34 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0181  PilT protein domain protein  34.62 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  33.75 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  29.92 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>