More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2040 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2040  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000297672  normal  0.161129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  90.4 
 
 		 125 aa  229  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  88.8 
 
 		 125 aa  227  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0204  30S ribosomal protein S13  84 
 
 		 125 aa  217  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2272  30S ribosomal protein S13  86.09 
 
 		 125 aa  210  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00112148  hitchhiker  0.00311978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1827  30S ribosomal protein S13  87.83 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0313  30S ribosomal protein S13  86.09 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  62.1 
 
 		 126 aa  163  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 125 aa  161  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 125 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  63.71 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 125 aa  156  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  55.65 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  54.4 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 123 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  54.47 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  58.26 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_002950  PG1914  30S ribosomal protein S13  59.46 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  53.66 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1930  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2989  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.183417 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  60.18 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  56.45 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0331  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 		 118 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  57.39 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 		 118 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 122 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 125 aa  139  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5048  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0590197  normal  0.99624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  56.78 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3614  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105943  normal  0.48549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3721  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0277516  normal  0.14692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  58.26 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3784  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3613  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000260189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  52.94 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3686  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  57.39 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  59.29 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  54.47 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>