186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02914 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02914  transposase  100 
 
 
159 aa  317  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01253  transposase  89.87 
 
 
159 aa  248  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  93.96 
 
 
322 aa  243  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  93.96 
 
 
322 aa  243  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  93.96 
 
 
322 aa  241  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  93.96 
 
 
260 aa  241  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  93.29 
 
 
322 aa  239  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00677  IS1112 transposase  92.19 
 
 
267 aa  239  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  93.29 
 
 
322 aa  239  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  93.29 
 
 
322 aa  239  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  93.29 
 
 
322 aa  239  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  93.29 
 
 
322 aa  239  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  91.28 
 
 
322 aa  238  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  91.95 
 
 
322 aa  238  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  91.28 
 
 
322 aa  238  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  93.29 
 
 
289 aa  238  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  90.6 
 
 
322 aa  237  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  92.62 
 
 
324 aa  235  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  89.26 
 
 
322 aa  230  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  89.26 
 
 
322 aa  230  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  89.26 
 
 
322 aa  230  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  89.26 
 
 
322 aa  230  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  89.26 
 
 
322 aa  230  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  89.26 
 
 
322 aa  230  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  88.59 
 
 
322 aa  230  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  88.59 
 
 
197 aa  229  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03302  transposase, IS30 family  94.44 
 
 
108 aa  201  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  91.23 
 
 
299 aa  170  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02862  transposase  93.33 
 
 
104 aa  140  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04492  transposase, IS30 family  81.43 
 
 
88 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 
315 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  37.24 
 
 
317 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  37.24 
 
 
246 aa  85.5  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  38.1 
 
 
315 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  38.1 
 
 
315 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  38.1 
 
 
315 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  38.1 
 
 
315 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  37.41 
 
 
313 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 
313 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 
313 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  36.69 
 
 
313 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 
313 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  36.69 
 
 
313 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 
313 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 
313 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 
313 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 
313 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  35.86 
 
 
335 aa  77.8  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  93.1 
 
 
249 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  35.86 
 
 
335 aa  77.4  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  35.86 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  35.86 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  35.86 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  93.48 
 
 
219 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
380 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  41.38 
 
 
273 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
342 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  35.62 
 
 
380 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4230  IS30 family transposase  34.35 
 
 
346 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382634  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  36.29 
 
 
332 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  43.56 
 
 
342 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13211  transposase  36.64 
 
 
394 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  36.67 
 
 
386 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4441  transposase, ISlxx5  38.78 
 
 
313 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  31.86 
 
 
290 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  31.86 
 
 
290 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  31.86 
 
 
290 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
251 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  35.06 
 
 
336 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0246651 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  39.58 
 
 
383 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  39.58 
 
 
383 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  38.83 
 
 
342 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  39.58 
 
 
383 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  39.58 
 
 
383 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  36.72 
 
 
340 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  39.58 
 
 
383 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  39.58 
 
 
383 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  39.58 
 
 
383 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3408  putative transposase IS30  39.58 
 
 
320 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>