29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3320 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  293  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 399 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 369 aa  80.5  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 402 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 416 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 397 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  51.92 
 
 		 400 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 		 426 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 387 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 387 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  52.27 
 
 		 387 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 411 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 389 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  50 
 
 		 387 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 369 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 408 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 417 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  45.21 
 
 		 404 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 391 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 408 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 411 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  35.51 
 
 		 414 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 404 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 386 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 425 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 399 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 397 aa  40.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>