61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3133 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  100 
 
 		 208 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  87.98 
 
 		 208 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  64.29 
 
 		 199 aa  254  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  56.25 
 
 		 199 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  56.99 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  55.91 
 
 		 199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  56.45 
 
 		 199 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  54.04 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  54.04 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  53.06 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  47.09 
 
 		 462 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  49.17 
 
 		 464 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  47.72 
 
 		 464 aa  171  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  43.68 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  40.18 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  45.88 
 
 		 240 aa  158  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  44.75 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  43.08 
 
 		 502 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  40.82 
 
 		 471 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  45.41 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  49.72 
 
 		 708 aa  142  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  41.53 
 
 		 191 aa  138  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  47.22 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  41.76 
 
 		 427 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  35.03 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  37.87 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  38.04 
 
 		 192 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  35.98 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  35.45 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  40 
 
 		 447 aa  111  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  41.26 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  38.89 
 
 		 192 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  33.49 
 
 		 235 aa  92.4  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  36.27 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  29.69 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  35.58 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 		 1001 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  35.58 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 1015 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 277 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.45 
 
 		 263 aa  48.5  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  24.29 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.77 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.71 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.71 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  34.4 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  29.17 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  24.75 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.36 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.36 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 241 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1706  quinohemoprotein amine dehydrogenase, subunit beta  29.37 
 
 		 358 aa  41.6  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>