More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6143 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  96.67 
 
 		 300 aa  554  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  76.57 
 
 		 302 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  68.09 
 
 		 297 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  66.34 
 
 		 294 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  64.38 
 
 		 300 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  61.44 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  65.89 
 
 		 294 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  65.23 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  65.56 
 
 		 296 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  44.22 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  42.25 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  40.42 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  43 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 126 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 126 aa  99.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 127 aa  99  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 126 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 216 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 126 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 127 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0473  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.21 
 
 		 248 aa  94  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1716  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  38.21 
 
 		 248 aa  94  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00444869  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 126 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 130 aa  94  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 394 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02492  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.5 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  33.96 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  33.96 
 
 		 231 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  34.68 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 127 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 126 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 128 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  38.1 
 
 		 131 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  34.94 
 
 		 229 aa  90.1  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  40.98 
 
 		 128 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 127 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 126 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 135 aa  89.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 127 aa  89.7  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 124 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 133 aa  89.4  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  37.21 
 
 		 234 aa  89.4  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 126 aa  89  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2764  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 466 aa  89  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  40.34 
 
 		 128 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 122 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 126 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 129 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 127 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 131 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 128 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 124 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 129 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2856  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 137 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  39.34 
 
 		 129 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 128 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  37.4 
 
 		 137 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  36 
 
 		 148 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 127 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0824  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 229 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  40.98 
 
 		 131 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.82 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  37.01 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.01 
 
 		 229 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 125 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 128 aa  87  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 127 aa  86.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 126 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.35 
 
 		 900 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  38.52 
 
 		 127 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  39.34 
 
 		 129 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  39.34 
 
 		 129 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  39.34 
 
 		 129 aa  86.7  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 243 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  39.34 
 
 		 139 aa  86.7  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  43.22 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  37.01 
 
 		 229 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 240 aa  86.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 231 aa  85.9  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 131 aa  86.3  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 242 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 129 aa  85.9  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 127 aa  85.9  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 236 aa  85.9  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.52 
 
 		 227 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  38.66 
 
 		 124 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  38.66 
 
 		 128 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  39.17 
 
 		 127 aa  85.5  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 132 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  38.66 
 
 		 130 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  40.98 
 
 		 129 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  36.22 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>