80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5820 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5820  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  313  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  96.2 
 
 
158 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  34.68 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  32.91 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  30 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  37.21 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4142  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  34.12 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
139 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  31.13 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  30.19 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 
147 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 
147 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  29.75 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  37.68 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  36.23 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  36.23 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  29.75 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3302  MutT/Nudix family protein  34.78 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.973400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  34.78 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  40.54 
 
 
530 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
146 aa  44.3  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 
147 aa  43.9  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
158 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  24.79 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2131  NUDIX family hydrolase  20.59 
 
 
153 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480915 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1314  NUDIX family hydrolase  21.01 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4099  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 
137 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  41.18 
 
 
325 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  28.32 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  30.47 
 
 
137 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2559  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.340623 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  43.94 
 
 
383 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3223  hypothetical protein  38.16 
 
 
147 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1352  NUDIX family hydrolase  20.59 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1336  NUDIX family hydrolase  20.59 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0415939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1949  hydrolase, NUDIX family  20.59 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
157 aa  40.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
165 aa  40.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
200 aa  40.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>