39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3572 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  93.77 
 
 		 273 aa  510  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  65.06 
 
 		 275 aa  361  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  65.88 
 
 		 269 aa  359  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  68.35 
 
 		 268 aa  333  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  64.89 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  65.85 
 
 		 266 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  65.85 
 
 		 266 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  63.01 
 
 		 266 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  63.41 
 
 		 266 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  48.81 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  46.86 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  46.86 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  46.27 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  45.96 
 
 		 278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  45.96 
 
 		 278 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  45.96 
 
 		 278 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  44.27 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 295 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  39.6 
 
 		 290 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  38.58 
 
 		 286 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  38.58 
 
 		 286 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  31 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  22.57 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  33.57 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  23.35 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0773  cytochrome c, class I  26.72 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206884  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 101 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  30.11 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  37 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1387  cytochrome c, class I  27.16 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  34.19 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.65 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  29.03 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  30.48 
 
 		 384 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  27.47 
 
 		 1139 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2508  cytochrome c class I  29.47 
 
 		 150 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>