71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0307 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  100 
 
 		 170 aa  338  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  94.12 
 
 		 170 aa  321  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  92.94 
 
 		 170 aa  315  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  78.16 
 
 		 175 aa  266  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  39.2 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  36.93 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  43.31 
 
 		 179 aa  131  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  41.62 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  43.4 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  39.08 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  43.05 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  48.48 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  37.5 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  40.13 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  38.22 
 
 		 178 aa  120  7e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  38.76 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  38.82 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  39.04 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  35.66 
 
 		 172 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  35.62 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  35.62 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  33.33 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  33.33 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  35.62 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  33.75 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  35.62 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  32.5 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  32.5 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  32.08 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  30 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  31.58 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  30.97 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  30.97 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  29.06 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  29.91 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  29.57 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  27.34 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  26.79 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  28.7 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  27.19 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  28.16 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  28.7 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  29.91 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  27.34 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  27.34 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  25.78 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  29.03 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  28.7 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  30.43 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  27 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  25 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  25 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  28 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  21.48 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  24.59 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  26.02 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  22.79 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  23.36 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  25.44 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  23.08 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  21.32 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  21.48 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  27.12 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  22.96 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  22.3 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  26 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  26 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  20.29 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  24.35 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  23.73 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  22.12 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>