More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1032 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1032  manganese ABC transporter  100 
 
 		 261 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19021  ABC transporter  98.47 
 
 		 261 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.49622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15251  ABC transporter  79.69 
 
 		 261 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1040  ABC transporter  77.22 
 
 		 261 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.195913  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11231  ABC transporter  79.3 
 
 		 262 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11311  ABC transporter  76.83 
 
 		 261 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11311  ABC transporter  76.06 
 
 		 261 aa  377  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.871959  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1366  ABC transporter  50 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.895775  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1606  ABC transporter  47.98 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0233225 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29261  ABC transporter  49.21 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  39.5 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  34.36 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  35.09 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  36.99 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  36.99 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  33.9 
 
 		 280 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  34.82 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  34.06 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.64 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.64 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.64 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.64 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.27 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  33.62 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.25 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  33.62 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  32.24 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.25 
 
 		 282 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.25 
 
 		 282 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.25 
 
 		 282 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.25 
 
 		 282 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  30.28 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  31.22 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  34.65 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  31.47 
 
 		 297 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  31.47 
 
 		 297 aa  95.5  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  29.02 
 
 		 287 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  31.47 
 
 		 297 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  27.37 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.16 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  30.64 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.12 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  27.31 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  32.63 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  28.94 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  32.73 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  32.55 
 
 		 282 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.93 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  30.52 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  31.95 
 
 		 290 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  25.82 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  28.15 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  28.15 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  29.07 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  25.82 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  29.17 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  26.53 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  29 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  31.36 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  26.23 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  26.82 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  32.46 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  33.05 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  28.76 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  25.88 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  27.85 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  29.39 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  31.44 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  30.29 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  30.89 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  26.98 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  30.89 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.34 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  28.76 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  28.76 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  29.86 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  28.74 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  29.88 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  29.33 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  31.13 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  27.91 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  30.61 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  28.89 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  31.91 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  28.91 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  25.94 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  29.06 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  27.42 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  28.37 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  28.74 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  29.96 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  28.36 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>