More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0089 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0089  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 156 aa  310  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07131  pentapeptide repeat-containing protein  96.79 
 
 		 156 aa  276  5e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0649  pentapeptide repeat-containing protein  50.98 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07051  pentapeptide repeat-containing protein  53.25 
 
 		 157 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06761  pentapeptide repeat-containing protein  50.98 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.168299  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1185  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  167  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07611  pentapeptide repeat-containing protein  52.23 
 
 		 158 aa  166  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  hitchhiker  0.00156438 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07151  pentapeptide repeat-containing protein  54.29 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.102033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1285  hypothetical protein  52.55 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.967033  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16121  hypothetical protein  48.18 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.385195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1609  pentapeptide repeat protein  46.58 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3657  pentapeptide repeat-containing protein  50.36 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3470  pentapeptide repeat-containing protein  48.87 
 
 		 167 aa  132  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3923  pentapeptide repeat protein  42.76 
 
 		 167 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0313  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  126  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.967815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3874  pentapeptide repeat protein  43.84 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0734  pentapeptide repeat-containing protein  49.62 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1548  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 		 172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0362  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 		 163 aa  87.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4307  pentapeptide repeat-containing protein  31.45 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.154552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0229  pentapeptide repeat protein  33.54 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.584528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2525  pentapeptide repeat protein  33.54 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1219  hypothetical protein  35.48 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4862  pentapeptide repeat-containing protein  36.25 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3581  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11313  predicted protein  38.76 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129582  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19861  hypothetical protein  30.99 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.028924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2759  pentapeptide repeat-containing protein  32.93 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  38.71 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16951  hypothetical protein  33.87 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1263  hypothetical protein  29.68 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08371  hypothetical protein  37.19 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0785  hypothetical protein  37.19 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.859693  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0575  pentapeptide repeat protein  38.4 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0592  pentapeptide repeat protein  38.4 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03791  pentapeptide repeat-containing protein  41.07 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08391  hypothetical protein  37.19 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08061  hypothetical protein  34.84 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10537  predicted protein  33.6 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0914569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0712  hpothetical protein  27.81 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15481  hypothetical protein  27.81 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09851  hypothetical protein  34 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.176778 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15111  pentapeptide repeat-containing protein  31.01 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.783575  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2954  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.916978 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_10544  predicted protein  33.33 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00165486  hitchhiker  0.0000000637684 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1536  hypothetical protein  34.15 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916018  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11471  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1053  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1448  pentapeptide repeat-containing protein  31.71 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11461  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  32.84 
 
 		 389 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11321  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1361  hypothetical protein  32.81 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1115  pentapeptide repeat protein  30.41 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0921  pentapeptide repeat-containing protein  30.82 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17771  pentapeptide repeat-containing protein  29.11 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114465  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2584  pentapeptide repeat protein  29.73 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.14087  normal  0.252585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  34.35 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11531  hypothetical protein  28.46 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0502913  normal  0.0854137 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8317  predicted protein  32.73 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0135698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15361  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15511  pentapeptide repeat-containing protein  29.01 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1840  hypothetical protein  29.77 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 381 aa  60.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  33.59 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  37.04 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  33.02 
 
 		 447 aa  58.9  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  41.33 
 
 		 350 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  32.03 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  32.32 
 
 		 886 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14041  pentapeptide repeat-containing protein  32.06 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276957  normal  0.0592863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  37.62 
 
 		 259 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  35 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  37.01 
 
 		 278 aa  57.4  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  31.29 
 
 		 866 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  38.52 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  30.21 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.28 
 
 		 734 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.36 
 
 		 745 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  33.07 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  39.47 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  32.48 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  37.17 
 
 		 1033 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  30.89 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.97 
 
 		 515 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  33.67 
 
 		 485 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2129  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.283688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3924  pentapeptide repeat-containing protein  33 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11235  predicted protein  32.26 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  38.04 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  35.79 
 
 		 710 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  32.61 
 
 		 526 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  36.11 
 
 		 903 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>