More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81459 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  77.99 
 
 
609 aa  773    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  100 
 
 
567 aa  1165    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  75.77 
 
 
607 aa  731    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  60.78 
 
 
589 aa  648    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  71.1 
 
 
485 aa  668    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  42.26 
 
 
812 aa  360  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13235  fructose-bisphosphate aldolase  42.57 
 
 
627 aa  357  3.9999999999999996e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00390046  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  42.6 
 
 
481 aa  353  5e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  37.25 
 
 
765 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07420  hypothetical protein  39 
 
 
859 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.592915  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_1733  predicted protein  36.44 
 
 
583 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0224275 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28984  predicted protein  39.56 
 
 
433 aa  266  8e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_1703  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  38.7 
 
 
672 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  35.35 
 
 
465 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46542  predicted protein  39.84 
 
 
545 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.893722  normal  0.156385 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9989  predicted protein  34.83 
 
 
620 aa  246  9e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860977  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1511  predicted protein  34.53 
 
 
560 aa  246  9e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.485737  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.18 
 
 
494 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10125  ATP-dependent RNA helicase (Drs1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14990)  37.09 
 
 
814 aa  242  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00305342  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  36.57 
 
 
755 aa  242  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  36.57 
 
 
710 aa  242  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03176  ATP-dependent rRNA helicase spb4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F4]  33.2 
 
 
638 aa  242  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.541811  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02850  ATP-dependent RNA helicase, putative  36.63 
 
 
484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.02 
 
 
480 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.86 
 
 
522 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.46 
 
 
525 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.46 
 
 
526 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.46 
 
 
525 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.59 
 
 
515 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02650  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 
808 aa  237  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
550 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16073  predicted protein  35.17 
 
 
474 aa  236  9e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.39 
 
 
497 aa  236  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.46 
 
 
506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  38 
 
 
466 aa  234  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.13 
 
 
513 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.6 
 
 
451 aa  234  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.36 
 
 
510 aa  233  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  37.22 
 
 
506 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05770  DNA/RNA helicase, superfamily II  36.71 
 
 
551 aa  233  7.000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000174624  hitchhiker  0.00467584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.36 
 
 
510 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.14 
 
 
491 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.33 
 
 
535 aa  232  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.6 
 
 
511 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.05 
 
 
578 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05150  conserved hypothetical protein  33.55 
 
 
606 aa  230  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.05 
 
 
549 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  37.8 
 
 
527 aa  231  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  37.15 
 
 
495 aa  229  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14032  predicted protein  36.77 
 
 
467 aa  229  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.73 
 
 
549 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.51 
 
 
415 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.31 
 
 
383 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.64 
 
 
506 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0945  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.07 
 
 
451 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0448  DEAD/DEAH box helicase-like  37.63 
 
 
458 aa  227  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0687758  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.51 
 
 
463 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.08 
 
 
567 aa  227  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.8 
 
 
589 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.16 
 
 
466 aa  226  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.26 
 
 
506 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  34.52 
 
 
609 aa  226  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.52 
 
 
609 aa  226  8e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.94 
 
 
439 aa  226  9e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.81 
 
 
580 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35 
 
 
482 aa  226  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.56 
 
 
463 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  34.44 
 
 
484 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0066  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.22 
 
 
414 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  36.77 
 
 
492 aa  225  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  35.62 
 
 
460 aa  225  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.47 
 
 
477 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.72 
 
 
485 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  34.72 
 
 
485 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.23 
 
 
571 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  34.72 
 
 
485 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  34.72 
 
 
485 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  34.72 
 
 
485 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.59 
 
 
515 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.59 
 
 
515 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.47 
 
 
496 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4297  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.33 
 
 
442 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.17 
 
 
486 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2955  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.68 
 
 
487 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 
522 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.17 
 
 
486 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  34.17 
 
 
486 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.77 
 
 
487 aa  223  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0522  ATP-dependent RNA helicase RhlB  37.5 
 
 
443 aa  223  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00923533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.17 
 
 
479 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.44 
 
 
488 aa  223  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.99 
 
 
479 aa  223  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00204  ATP-dependent RNA helicase dbp7 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGX6]  31.83 
 
 
778 aa  223  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.9 
 
 
514 aa  223  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05623  conserved hypothetical protein  33.93 
 
 
567 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0060242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1769  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.69 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327095  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.17 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.55 
 
 
418 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0320  hypothetical protein  36.75 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40877  predicted protein  35.64 
 
 
546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>