94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80765 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_80765  predicted protein  100 
 
 		 271 aa  563  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10765  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G (eIF3g)(Translation initiation factor eIF3 p33 subunit homolog)(eIF3 p33 homolog)(Eukaryotic translation initiation factor 3 RNA-binding subunit)(eIF-3 RNA-binding subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0B3]  40 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0100571 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6420  predicted protein  38.11 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01460  eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 4 delta, 44kDa, putative  36.74 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.588501  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16281  predicted protein  45.78 
 
 		 84 aa  73.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.398668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 		 122 aa  52.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1009  glycine-rich RNA binding protein  34.83 
 
 		 128 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000973374  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  32.58 
 
 		 732 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1139  RNA binding protein  34.83 
 
 		 129 aa  50.8  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000522116  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5724  predicted protein  37.8 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181544  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  40.62 
 
 		 102 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  43.75 
 
 		 101 aa  49.7  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  38.1 
 
 		 838 aa  49.3  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05560  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  38.71 
 
 		 479 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  34.21 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  39.68 
 
 		 97 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  36.51 
 
 		 107 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  38.71 
 
 		 1290 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  34.57 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0508  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.51 
 
 		 65 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  34.43 
 
 		 874 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09095  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 4 (PPIase)(Rotamase)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARI5]  28.26 
 
 		 461 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.844465 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24530  predicted protein  31.51 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00133033  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  34.12 
 
 		 673 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  36.51 
 
 		 112 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02989  glycine-rich RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08580)  32.43 
 
 		 128 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  36.62 
 
 		 499 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  36.36 
 
 		 605 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1536  RNP-1 like RNA-binding protein  42.03 
 
 		 104 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217942 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2340  RNA-binding protein  48.98 
 
 		 152 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791168  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0482  HIT family protein  44.68 
 
 		 65 aa  46.2  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.417177  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  40.74 
 
 		 157 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02490  hypothetical protein  32.79 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.471511  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01270  U1 snRNP 70K protein (short form), putative  37.66 
 
 		 429 aa  46.2  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  37.31 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  39.39 
 
 		 104 aa  45.4  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  37.93 
 
 		 101 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  32.53 
 
 		 245 aa  45.4  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  34.38 
 
 		 82 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  43.48 
 
 		 110 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4708  RNP-1 like RNA-binding protein  34.62 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000908664  normal  0.0456447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0233  RNA-binding protein  35.37 
 
 		 149 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540695  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  32.93 
 
 		 572 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  34.29 
 
 		 89 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0195  RNA-binding protein  35.37 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237988  normal  0.0118199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0182  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000432928  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 		 88 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4336  RNP-1-like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 155 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000106713  hitchhiker  0.0000013394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  34.57 
 
 		 103 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4176  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433028  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  34.78 
 
 		 87 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0178  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203464  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3508  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 		 90 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0140  RNP-1-like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000056681  normal  0.0664394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4074  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000591995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8445  predicted protein  42.11 
 
 		 67 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  27.27 
 
 		 434 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  38.24 
 
 		 96 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04665  hypothetical protein  32.26 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0330259  normal  0.410978 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04870  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 504 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.393554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 90 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  34.04 
 
 		 108 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3413  hypothetical protein  39.68 
 
 		 83 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.212369  normal  0.0411196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  39.06 
 
 		 102 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  30.86 
 
 		 143 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 147 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000340315  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4324  RNP-1 like RNA-binding protein  29.82 
 
 		 155 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000014654  normal  0.0291528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 		 111 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4264  RNP-1 like RNA-binding protein  29.82 
 
 		 155 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0181  RNP-1-like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814275  normal  0.581259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208  RNA-binding protein  36.25 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0180  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000725181  normal  0.749946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0175  RNP-1 like RNA-binding protein  35.37 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  hitchhiker  0.00946838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  40.3 
 
 		 95 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  39.06 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  32.5 
 
 		 95 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  26.14 
 
 		 477 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 		 97 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  45.65 
 
 		 88 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  37.7 
 
 		 694 aa  42.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8830  predicted protein  42.22 
 
 		 122 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0913376 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3507  predicted protein  28.26 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.22649 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16633  predicted protein  45.45 
 
 		 81 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.13 
 
 		 88 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  39.06 
 
 		 105 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  33.85 
 
 		 114 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  33.82 
 
 		 107 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 		 103 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0166  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 		 151 aa  42  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000221523  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 		 92 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 		 116 aa  42  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 		 92 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>