35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_72239 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_72239  protein required for normal CLN1 and CLN2 G1 cyclin expression  100 
 
 		 1120 aa  2271    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270618 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11128  RNA polymerase II transcription elongation factor (Ctr9), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G05870)  28.78 
 
 		 1027 aa  343  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0503014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00490  Pol II transcription elongation factor, putative  24 
 
 		 1186 aa  142  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.84309  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14940  predicted protein  21.37 
 
 		 1059 aa  110  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0306125  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42758  predicted protein  25.35 
 
 		 1346 aa  93.2  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.59748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  21.72 
 
 		 1013 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.08 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.65 
 
 		 632 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1276 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  23.32 
 
 		 725 aa  51.6  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 409 aa  51.6  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.12 
 
 		 397 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 344 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.61 
 
 		 586 aa  50.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.92 
 
 		 344 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.84 
 
 		 573 aa  49.7  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 		 467 aa  49.3  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.62 
 
 		 810 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  20.93 
 
 		 414 aa  48.5  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 4079 aa  48.5  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  22.74 
 
 		 833 aa  48.1  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 878 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.84 
 
 		 1979 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  25.66 
 
 		 694 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 543 aa  46.6  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  24.49 
 
 		 379 aa  46.6  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 565 aa  46.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.24 
 
 		 1069 aa  45.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 244 aa  45.8  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 366 aa  45.8  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  26.8 
 
 		 321 aa  45.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.66 
 
 		 745 aa  45.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  33.68 
 
 		 267 aa  44.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.2 
 
 		 2401 aa  44.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3025  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 185 aa  44.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>