More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_55711 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_55711  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 445 aa  900    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.486902  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04130  Dihydroorotate dehydrogenase, mitochondrial precursor, putative  48.13 
 
 		 591 aa  352  8e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  44.03 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  41.62 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.72 
 
 		 364 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.72 
 
 		 364 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.9 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.43 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.84 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.73 
 
 		 357 aa  246  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.5 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.5 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.64 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  39.67 
 
 		 374 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.48 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.18 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.87 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 356 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.27 
 
 		 364 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  41 
 
 		 363 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  44.06 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  39.79 
 
 		 348 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  43.11 
 
 		 361 aa  237  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.62 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.27 
 
 		 357 aa  236  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.57 
 
 		 358 aa  235  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.17 
 
 		 362 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.44 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.86 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.04 
 
 		 358 aa  230  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.16 
 
 		 361 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.77 
 
 		 362 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.11 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  39.94 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.66 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  42.44 
 
 		 346 aa  226  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.38 
 
 		 331 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.91 
 
 		 351 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.3 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  37.85 
 
 		 396 aa  222  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  42.9 
 
 		 339 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.14 
 
 		 357 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.03 
 
 		 341 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  39 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.04 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.67 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.04 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.04 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  38.48 
 
 		 355 aa  221  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  41.05 
 
 		 356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.61 
 
 		 348 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.27 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.43 
 
 		 359 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.57 
 
 		 375 aa  219  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.21 
 
 		 362 aa  219  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.22 
 
 		 358 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.32 
 
 		 344 aa  219  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  38.42 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  39.5 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.04 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  35.89 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.16 
 
 		 355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  37.08 
 
 		 340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1724  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.76 
 
 		 351 aa  216  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.4 
 
 		 344 aa  216  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  40.11 
 
 		 336 aa  216  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.55 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.33 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.71 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.71 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  40.42 
 
 		 357 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.38 
 
 		 339 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  37.9 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.71 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.22 
 
 		 339 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.43 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  38.46 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  38.63 
 
 		 363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.9 
 
 		 344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.62 
 
 		 347 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.48 
 
 		 352 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.93 
 
 		 356 aa  213  7e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.6 
 
 		 339 aa  212  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.32 
 
 		 336 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05909  Dihydroorotate dehydrogenasePutative uncharacterized protein (EC 1.3.1.14); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q12610]  38.21 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.67 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.86 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.15 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.68 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.46 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.68 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.5 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.87 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  41.32 
 
 		 336 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.99 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  41.32 
 
 		 336 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.32 
 
 		 336 aa  211  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.32 
 
 		 336 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.5 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.32 
 
 		 336 aa  211  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>