More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40468 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_40468  succinate semialdehyde dehydrogenase NADP+ linked  100 
 
 
493 aa  1023    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.920586  normal  0.107865 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03829  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  54.1 
 
 
531 aa  548  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10011  succinate semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  53.67 
 
 
497 aa  520  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.67 
 
 
479 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.67 
 
 
479 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.87 
 
 
493 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.04 
 
 
486 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57266  succinate-semialdehyde dehydrogenase NADP+ dependent  51.36 
 
 
504 aa  489  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.876007 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
489 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.97 
 
 
489 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.45 
 
 
492 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.04 
 
 
483 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01570  succinate-semialdehyde dehydrogenase, putative  48.16 
 
 
561 aa  487  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0842141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.75 
 
 
500 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
489 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
489 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.93 
 
 
489 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.93 
 
 
489 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.29 
 
 
480 aa  481  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.03 
 
 
482 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.34 
 
 
500 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.93 
 
 
489 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.93 
 
 
489 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
479 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  47.62 
 
 
482 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.62 
 
 
482 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.63 
 
 
483 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.78 
 
 
503 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.56 
 
 
492 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
484 aa  478  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.62 
 
 
482 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.83 
 
 
482 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  47.62 
 
 
482 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.62 
 
 
482 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.76 
 
 
492 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.62 
 
 
482 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.36 
 
 
503 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
479 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
493 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  48.12 
 
 
480 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.42 
 
 
484 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0598  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
492 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.98 
 
 
486 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5862  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.15 
 
 
485 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.66 
 
 
486 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.7 
 
 
489 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.91 
 
 
489 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  47.91 
 
 
489 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.87 
 
 
500 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.91 
 
 
489 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.91 
 
 
489 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.91 
 
 
489 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.22 
 
 
486 aa  471  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.13 
 
 
480 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
488 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.6 
 
 
493 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  47.91 
 
 
489 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.42 
 
 
492 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.22 
 
 
483 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.72 
 
 
480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.33 
 
 
486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.96 
 
 
492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.86 
 
 
482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.86 
 
 
482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.34 
 
 
511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.6 
 
 
483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.45 
 
 
488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.39 
 
 
490 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.86 
 
 
482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.39 
 
 
493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.72 
 
 
480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.72 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.74 
 
 
484 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.41 
 
 
492 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.3 
 
 
493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.51 
 
 
488 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.6 
 
 
485 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.96 
 
 
482 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
488 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
483 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.22 
 
 
509 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.93 
 
 
482 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.71 
 
 
485 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.86 
 
 
482 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  49.06 
 
 
494 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6346  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.24 
 
 
490 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  47.84 
 
 
491 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  46.72 
 
 
497 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1778  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.35 
 
 
496 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  46.68 
 
 
480 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00900  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+), putative  47.66 
 
 
500 aa  462  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.825171  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.72 
 
 
482 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.62 
 
 
480 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.72 
 
 
482 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
483 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.1 
 
 
484 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  46.06 
 
 
482 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1978  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.56 
 
 
496 aa  464  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>