More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57266 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_57266  succinate-semialdehyde dehydrogenase NADP+ dependent  100 
 
 		 504 aa  1035    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.876007 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03829  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  57.79 
 
 		 531 aa  576  1.0000000000000001e-163  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.01 
 
 		 503 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.62 
 
 		 503 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.8 
 
 		 486 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.39 
 
 		 482 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.39 
 
 		 482 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.39 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  48.98 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.39 
 
 		 482 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.98 
 
 		 482 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  48.98 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.98 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.51 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.82 
 
 		 480 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 489 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.82 
 
 		 480 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  50.1 
 
 		 489 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.82 
 
 		 480 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50 
 
 		 480 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 489 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 		 486 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.51 
 
 		 489 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 489 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  49.79 
 
 		 482 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.66 
 
 		 490 aa  499  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 489 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07315  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  50.3 
 
 		 492 aa  495  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.223586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.16 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.2 
 
 		 488 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_006686  CND01570  succinate-semialdehyde dehydrogenase, putative  52.93 
 
 		 561 aa  498  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0842141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.16 
 
 		 482 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.39 
 
 		 480 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.49 
 
 		 483 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.16 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.16 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 493 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10011  succinate semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  50.31 
 
 		 497 aa  493  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.2 
 
 		 480 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.18 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.49 
 
 		 489 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.62 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.89 
 
 		 489 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.46 
 
 		 483 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40468  succinate semialdehyde dehydrogenase NADP+ linked  51.43 
 
 		 493 aa  490  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.920586  normal  0.107865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.67 
 
 		 483 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.09 
 
 		 489 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.29 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00900  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+), putative  49.4 
 
 		 500 aa  486  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.825171  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.28 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  49.28 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 		 509 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.06 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.65 
 
 		 486 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 		 488 aa  487  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.28 
 
 		 483 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.29 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.89 
 
 		 489 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.29 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 485 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.41 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.84 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.44 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.15 
 
 		 485 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.45 
 
 		 490 aa  482  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.6 
 
 		 490 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.07 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  48.86 
 
 		 491 aa  480  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.35 
 
 		 485 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.2 
 
 		 490 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.48 
 
 		 492 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.38 
 
 		 486 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.15 
 
 		 486 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.35 
 
 		 488 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2636  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.67 
 
 		 488 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.23 
 
 		 486 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.87 
 
 		 482 aa  480  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.02 
 
 		 493 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.95 
 
 		 484 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.65 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.05 
 
 		 487 aa  475  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.87 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.94 
 
 		 492 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.57 
 
 		 482 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.75 
 
 		 489 aa  477  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.36 
 
 		 482 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.36 
 
 		 482 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.36 
 
 		 482 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.57 
 
 		 488 aa  475  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.64 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.25 
 
 		 500 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.43 
 
 		 492 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.36 
 
 		 482 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.02 
 
 		 492 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.03 
 
 		 486 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.96 
 
 		 481 aa  472  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>