More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30193 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_30193  enoyl CoA hydratase  100 
 
 
273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  31.23 
 
 
280 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.42 
 
 
270 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 
270 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  30.97 
 
 
270 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 
270 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_006686  CND02600  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.563575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  29.48 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  29.89 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.36 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  30.38 
 
 
291 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.49 
 
 
279 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.29 
 
 
291 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 
287 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
274 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  27.02 
 
 
270 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 
286 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.29 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
275 aa  99  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  30.15 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  29.08 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  29.08 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  29.08 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.94 
 
 
280 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  28.69 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  27.31 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.02 
 
 
967 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.7 
 
 
276 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
247 aa  92.8  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.62 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.48 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.2 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.53 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  31.17 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.26 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.57 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.53 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.66 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.72 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3963  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.21 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  27.92 
 
 
263 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.56 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  29.95 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.35 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.1 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.02 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  29.02 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  25.11 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.61 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  27.37 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  26.54 
 
 
261 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  27.67 
 
 
261 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.7 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  25.1 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  29.34 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.47 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  26.55 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.63 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  26.84 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.73 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.99 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  27.73 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  28.38 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  27.23 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6084  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.05 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  28.5 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  26.67 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.48 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.84 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.62 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.61 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.28 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.69 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.8 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.33 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  28.44 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  27.76 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  27.04 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  27.53 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.72 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  25.11 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4225  enoyl-CoA hydratase  29 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.13 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  27.53 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  27.53 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>