221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7342 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_7342  predicted protein  100 
 
 
106 aa  216  7.999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  50.94 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  48.54 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  51.55 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  50.52 
 
 
104 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  54.95 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  54.95 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  46.6 
 
 
110 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  54.74 
 
 
116 aa  105  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  54.74 
 
 
116 aa  105  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  48.08 
 
 
112 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  41.12 
 
 
217 aa  101  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  46.67 
 
 
111 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  45.71 
 
 
111 aa  94.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  43.52 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  43.4 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  48.28 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  42.42 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  43.43 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  44.44 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  38.78 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  41.41 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  42.42 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  38.38 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  41.41 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  41.67 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  38.38 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  39.8 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  39.78 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  39.39 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_006686  CND05570  conserved hypothetical protein  44.21 
 
 
445 aa  72.8  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  39.18 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  40.59 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  40.4 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  39.18 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  40.4 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  40.4 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  37.11 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  36.36 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  38.38 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  38.14 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  42.55 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  38 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  38.78 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  33.33 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  36.56 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  38.78 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  46.75 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  44.16 
 
 
113 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  36.27 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  42.86 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1880  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.37 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.871974  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  38.71 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.45 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  36.73 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  37.25 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  39.36 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  35.71 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  36.73 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.45 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  35.71 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  38.78 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  36.63 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  38.3 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1149  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.86 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796638  normal  0.0925301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  44.16 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.16 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.16 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  44.16 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  37.76 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.16 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  35.71 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1703  ferredoxin, 2Fe-2S  44.74 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0360093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2727  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.74 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2158  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.86 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2031  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.86 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  33.66 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2212  2Fe-2S ferredoxin  44.74 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3108  2Fe-2S ferredoxin  44.74 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.514759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2594  2Fe-2S ferredoxin  44.74 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2650  2Fe-2S ferredoxin  44.74 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1484  2Fe-2S ferredoxin  44.74 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.16 
 
 
111 aa  62.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.56 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  41.56 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  36.46 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  43.96 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2121  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.56 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.568934  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  36.46 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  36.46 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0877  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.75 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.316762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  43.96 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  35.05 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.16 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.45 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4331  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  46.75 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.850954  decreased coverage  0.0000000000132969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  35.05 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  36.56 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1453  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.42 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.821654 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  34.34 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>