More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44906 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 304 aa  626  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  55.56 
 
 		 297 aa  324  9e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 284 aa  275  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  46.48 
 
 		 284 aa  265  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  45.3 
 
 		 284 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  45.64 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  46.13 
 
 		 284 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  48.41 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  45.07 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  47.83 
 
 		 283 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  43.86 
 
 		 284 aa  250  3e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  47.18 
 
 		 289 aa  248  8e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  46.88 
 
 		 296 aa  248  9e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  44.21 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  42.91 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  42.96 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  42.96 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  44.41 
 
 		 300 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  44.67 
 
 		 309 aa  245  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 		 292 aa  244  9e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  44.68 
 
 		 284 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  46.71 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  48.6 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  44.68 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  45.91 
 
 		 285 aa  238  9e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  43.42 
 
 		 284 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  43.97 
 
 		 284 aa  235  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  43.26 
 
 		 290 aa  234  9e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  41.32 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  43.42 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  43.99 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  45.23 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  43.55 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  43.82 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  43.9 
 
 		 296 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0452  formyltetrahydrofolate deformylase  45.65 
 
 		 286 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  45.1 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 		 287 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  44.86 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  44.86 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  43.36 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  44.76 
 
 		 287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  43.64 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  44.52 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  43 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  42.35 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  45.39 
 
 		 294 aa  225  8e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3546  formyltetrahydrofolate deformylase  45 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  45.7 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  44.72 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  42.76 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  44.33 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  45.3 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  45.32 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  45.1 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  42.61 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  44.73 
 
 		 284 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  44.33 
 
 		 285 aa  221  8e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  42.7 
 
 		 284 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  45.09 
 
 		 282 aa  221  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  42.35 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  43.31 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  42.35 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  43.31 
 
 		 283 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  41.84 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  42.61 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  42.46 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  43.82 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  43 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  42.6 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  43.21 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  43.3 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  44.6 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  44.48 
 
 		 291 aa  215  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 		 287 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  42.55 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  42.25 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  43.25 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  42.25 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  42.25 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  42.25 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  41.26 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  43.4 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  42.55 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  42.41 
 
 		 295 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  44.64 
 
 		 287 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  44.07 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  42.4 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  40.93 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  41.5 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  42.46 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  41.75 
 
 		 288 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  39.58 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>