More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19103 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_19103  predicted protein  100 
 
 		 102 aa  212  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39161  Putative mitochondrial ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 102 aa  103  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1405  30S ribosomal protein S16  48.48 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.321443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  47.06 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 87 aa  90.9  6e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0798  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  45.74 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  44.12 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  50 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 86 aa  88.6  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  41.18 
 
 		 201 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4205  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.847506  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  42.16 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  46 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  48.19 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 191 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  45.16 
 
 		 116 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3276  30S ribosomal protein S16  40.2 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07701  37S ribosomal protein S16 (AFU_orthologue; AFUA_5G08350)  43.52 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.741013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  41.35 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0123  ribosomal protein S16  45.95 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.622663  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  44.09 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  40.91 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60011  predicted protein  45.92 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.49204  normal  0.483859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  44.58 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  44.09 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  44.32 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  44.12 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2780  30S ribosomal protein S16  45.1 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00569729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  42.55 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  43.37 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  43.14 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  41.67 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  41.49 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  40.59 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  42.68 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  42.17 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  39.6 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  46.51 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  44.16 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4075  30S ribosomal protein S16  42.68 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  44.58 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  45.45 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  41.67 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3579  30S ribosomal protein S16  42.16 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  41.67 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  45.78 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  46.34 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  39.58 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  38.24 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  37.25 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  42.17 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  44.68 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  37.25 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  42.17 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1649  ribosomal protein S16  46.84 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  40.96 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  41.46 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  41.46 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  40.96 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  43.37 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  40.96 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  40.96 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  45.12 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  40.96 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  40.96 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  40.96 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  40.96 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  40.96 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  45.12 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  43.37 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  41.98 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  40.96 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  38.24 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  38.54 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>