More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0464 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 423 aa  870    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  62.65 
 
 		 423 aa  547  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  59.86 
 
 		 423 aa  529  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  58.91 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1608  adenylosuccinate synthetase  59.91 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.395219  normal  0.555835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  60.61 
 
 		 425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4579  adenylosuccinate synthetase  59.15 
 
 		 431 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  55.92 
 
 		 431 aa  481  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7050  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  48.49 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 434 aa  398  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  47.43 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  47.21 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  47.07 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  47.87 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  47.87 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  47.63 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  47.62 
 
 		 415 aa  376  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  47.31 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  44.52 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  47.98 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  46.28 
 
 		 416 aa  368  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  46.34 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 		 430 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  47.98 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  45.77 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  47.42 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  44.96 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  43.9 
 
 		 442 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  47.11 
 
 		 416 aa  368  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  46.26 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  46.56 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 432 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  47.43 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  47.32 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  46.95 
 
 		 432 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  47.13 
 
 		 432 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  46.7 
 
 		 432 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  44.76 
 
 		 430 aa  362  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 444 aa  362  9e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  46.23 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 		 427 aa  362  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  46.59 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  46.92 
 
 		 431 aa  361  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  47.88 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  45.94 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 416 aa  360  4e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  46.32 
 
 		 432 aa  359  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 		 428 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  45.58 
 
 		 427 aa  359  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  46.54 
 
 		 430 aa  358  7e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  45.41 
 
 		 437 aa  358  9e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  44.92 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  46.35 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  46.7 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  46.17 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  46.14 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  45.24 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  46.35 
 
 		 447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  43.02 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1784  adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 		 416 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0153593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  45.28 
 
 		 447 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  46.1 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  47.31 
 
 		 451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  46.06 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  47.9 
 
 		 431 aa  356  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  47.9 
 
 		 431 aa  356  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  44.96 
 
 		 427 aa  356  5.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  44.96 
 
 		 427 aa  356  5.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  47.9 
 
 		 431 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  46.6 
 
 		 432 aa  355  7.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>