44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4541 on replicon NC_011723
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  53.01 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  40.59 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  40.86 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  34 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  36.08 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  30.43 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  34.78 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  31.87 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  33.72 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  35.38 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0795  hypothetical protein  31.65 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1137  hypothetical protein  45.83 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.532665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  34.72 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  34.78 
 
 		 93 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  34.78 
 
 		 93 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  28.12 
 
 		 95 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0281  hypothetical protein  29.73 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  28.42 
 
 		 277 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>