93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2672 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 315 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.37 
 
 		 317 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.05 
 
 		 317 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.73 
 
 		 319 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.26 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  56.41 
 
 		 318 aa  388  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.1 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0116647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1087  hypothetical protein  47.63 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000930437 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18351  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.27 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.279534 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  36.79 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  35.89 
 
 		 339 aa  225  9e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.87 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.81 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  33.75 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06081  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.81 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  35.94 
 
 		 328 aa  198  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  35.94 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06471  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.45 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.15 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  22.22 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.07 
 
 		 341 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 352 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.75 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  26.45 
 
 		 319 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 		 335 aa  49.3  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  26.61 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.71 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.38 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.64 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.97826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.39 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.38 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  18.5 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1726  hypothetical protein  25.58 
 
 		 482 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 466 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 466 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000813821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 466 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1504  NAD dependent protein  27.87 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.32 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  23.89 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.95 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.31 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  22.22 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.26 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  26.42 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.24 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  25.64 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  36.23 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.73 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.73 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.73 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.42 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.527248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865539  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  38.16 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.526116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2737  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.71 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1956  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.14 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000864089  hitchhiker  0.00126231 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.64 
 
 		 196 aa  43.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.29 
 
 		 346 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  41.27 
 
 		 1498 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2948  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.25 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.73 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  33.33 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  36.84 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 		 240 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  23.53 
 
 		 217 aa  43.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.69 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  36.84 
 
 		 320 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.31 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.27 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  32.39 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4290  fatty acid hydroxylase  28.3 
 
 		 412 aa  42.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  36.25 
 
 		 213 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.16 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.99 
 
 		 339 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03949  NAD(P)H steroid dehydrogenase  23.26 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>