176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2193 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2193  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 336 aa  703    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00124948 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5485  Radical SAM domain protein  62.26 
 
 		 316 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.269586 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1575  Radical SAM domain protein  40.32 
 
 		 342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1576  Radical SAM domain protein  41.1 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  32.64 
 
 		 261 aa  92.8  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  32.29 
 
 		 182 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  28.14 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 276 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  29.65 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 		 269 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2102  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  29.65 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  26.77 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  29 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  28.27 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  24.26 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1900  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  27.92 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  26.26 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  26.26 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  25.87 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  25.25 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.78 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  26.77 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  27.66 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  25.76 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  29.57 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2161  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0231722 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  26.26 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1030  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  28.64 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2479  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  26.26 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2670  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  27.92 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2599  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2493  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1107  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.614864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2091  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000137131  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  27.37 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  24.75 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1808  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0645523  normal  0.369217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3183  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0729  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3795  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  26.53 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  26.63 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  27 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1485  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  32.14 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2530  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>